-
1 RNA processing
процессинг РНК
Процесс созревания эукариотической РНК
[ http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech_Eng-Rus.pdf]Тематики
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > RNA processing
-
2 RNA processing
РНК-процессинг — см. Процессинг.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RNA processing
-
3 Bioinformatics
Биоинформатика — новое направление исследований, использующее математические и алгоритмические методы для решения молекулярно-биологических задач. В отечественной генетике зарождение этого направления тесно связано со становлением и развитием Института цитологии и генетики СО АН СССР в Новосибирском Академгородке. Первая международная конференция по Б. регуляции и структуры генома в странах СНГ была организована и проведена в этом институте (24–31 августа 1998 г.). Совершенствование экспериментальных методов приводит к экспоненциальному росту молекулярно-биологических данных и возникновению абсолютно новой для биологии междисциплинарной задачи анализа и хранения информации из лабораторий, рассеянных по всему миру. Задачи Б. можно определить как развитие и использование математических и компьютерных методов для решения проблем молекулярной биологии. Выделяют: (1) Задачу поддержания и обновления баз данных. Современная эра в молекулярной биологии началась с момента открытия двойной спирали Уотсоном и Криком в 1953 г. Эта революция породила большой объем данных полученных прямым чтением ДНК из разных участков геномов. Быстрое секвенирование стало возможно 10 лет назад, первый полностью секвенированный геном — геном бактерии Haemophilus influenzae, 1800 т.п.н. В 1996 г. закончено секвенирование первого генома эукариот, генома дрожжей (10 млн п.н.) и секвенирование продолжается со скоростью более 7 миллионов нуклеотидов в год. Знание геномной ДНК в значительной мере сделало возможным ряд фундаментальных биологических открытий, таких как интроны, самосплайсирующиеся РНК (см. РНК-процессинг), обратная транскрипция и псевдогены. Однако существующие базы данных не вполне адекватны требованиям молекулярных биологов: одной из нерешенных проблем является создание программного обеспечения для простого и гибкого доступа к данным. (2) Другой класс задач в большей степени ориентирован на поиск оптимальных алгоритмов для анализа последовательностей. Типичным примером такой задачи является задача выравнивания: как выявить сходство между двумя последовательностями, зная их нуклеотидный состав? Задача решается множество раз в день, поэтому нужен оптимальный алгоритм с минимальным временем выравнивания. (3) Можно также выделить ряд направлений современной Б.: создание и поддержка баз данных (БД) регуляторных последовательностей и белков; БД по регуляции генной экспрессии; БД по генным сетям; компьютерный анализ и моделирование метаболических путей; компьютерные методы анализа и распознавания в геноме регуляторных последовательностей; методы анализа и предсказания активности функциональных сайтов в нуклеотидных последовательностях геномов; компьютерные технологии для изучения генной регуляции; предсказания структуры генов; моделирование транскрипционного и трансляционного контроля генной экспрессии; широкомасштабный геномный анализ и функциональное аннотирование нуклеотидных последовательностей; поиск объективных методов аннотирования и выявления различных сигналов в нуклеотидных последовательностях; эволюция регуляторных последовательностей в геномах; характеристики белковой структуры, связанные с регуляцией; экспериментальные исследования механизмов генной экспрессии и развитие интерфейса, связывающего экспериментальные данные с компьютерным анализом геномов. Первые работы по компьютерному анализу последовательностей биополимеров появились еще в 1960-1970-х годах, однако формирование вычислительной биологии как самостоятельной области началось в 1980-х годах после развития методов массового секвенирования ДНК. С точки зрения биолога-экспериментатора, можно выделить пять направлений вычислительной биологии: непосредственная поддержка эксперимента (физическое картирование (см. Физическая карта), создание контиг (см.) и т.п.), организация и поддержание банков данных, анализ структуры и функции ДНК и белков, эволюционные и филогенетические исследования, а также собственно статистический анализ нуклеотидных последовательностей. Разумеется, границы между этими направлениями в значительной мере условны: результаты распознавания белок-кодирующих областей используются в экспериментах по идентификации генов, одним из основных методов предсказания функции белков является поиск сходных белков в базах данных, а для осуществления детального предсказания клеточной роли белка необходимо привлекать филогенетические соображения. В 1982 г. возникли GenBank и EMBL — основные банки нуклеотидных последовательностей. Вскоре после этого были созданы программы быстрого поиска по банку — FASTA и затем BLAST. Позднее были разработаны методы анализа далеких сходств и выделения функциональных паттернов в белках. Оказалось, что даже при отсутствии близких гомологов, можно достаточно уверенно предсказывать функции белков. Эти методы с успехом применялись при анализе вирусных геномов, а затем и позиционно клонированных генов человека. Алгоритмы анализа функциональных сигналов в ДНК ( промоторов, операторов, сайтов связывания рибосом) менее надежны, однако и они в ряде случаев были успешно применены, напр., при анализе пуринового регулона Escherichia coli. Идет активная работа над созданием алгоритмов предсказания вторичной структуры РНК. Алгоритмические аспекты этой проблемы были разрешены достаточно быстро, однако оказалось, что точность экспериментально определенных физических параметров не позволяет осуществлять надежные предсказания. В то же время, сравнительный подход, позволяющий построить общую структуру для группы родственных или выполняющих одну и ту же функцию РНК, дает существенно более точные результаты. Другим важным достижением, связанным с рибосомальными РНК, стало построение эволюционного древа прокариот и вытекающей из него естественной классификации бактерий, используемой в банках нуклеотидных последовательностей, в частности GenBank. Статистическая информация (в виде предсказания GenScan), последовательности гомологичных белков и последовательности EST являются исходным материалом для предсказания генов в последовательностях ДНК человека программой ААТ. Алгоритмы, объединяющие анализ функциональных сигналов в нуклеотидных последовательностях и предсказание вторичной структуры РНК, используются для поиска генов тРНК и самосплайсирующихся интронов. Одновременный анализ белковых гомологий и функциональных сигналов позволил получить интересные результаты при эволюцию системы репликации по механизму катящегося кольца. Опыт показывает, что надежное предсказание функции белка по аминокислотной последовательности возможно лишь при одновременном применении разнонаправленных программ структурного и функционального анализа. Основное — это приближение теоретических методов к биологической практике. Во-первых, вновь создаваемые алгоритмы все ближе имитируют работу биолога. В частности, был формализован итеративный подход к поиску родственных белков в банках данных, позволяющий работать со слабыми гомологиями и искать отдаленные члены белковых семейств. При этом все члены семейства, идентифицированные на очередном шаге, используются для создания очередного образа семейства, являющегося основой для следующего запроса к базе данных. Другим примером являются алгоритмы, формализующие сравнительный подход к предсказанию вторичной структуры регуляторных РНК. Во-вторых, создаваемые алгоритмы непосредственно приближаются к экспериментальной практике. Так, повышение избирательности методов распознавания белок-кодирующих областей (возможно, за счет уменьшения чувствительности) позволяет осуществлять предсказание специфичных гибридизационных зондов и затравок ПЦР. Наконец, развитие Интернета — электронной почты и затем WWW — сняло зависимость от модели компьютера и операционной системы и сделало программы универсальным рабочим инструментом.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Bioinformatics
-
4 splicing
Форма процессинга предшественников мРНК у эукариот; в результате С. происходит удаление из молекулы-предшественника последовательностей интронов intron и ковалентное соединение последовательностей экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.* * *1. см. ДНК-сплайсинг.2. РНК-сплайсинг (РНК-процессинг, см.): малые ядерные РНК катализируют эксцизию (вырезание) интронов из молекулы пре-иРНК (первичный транскрипт) и лигирование экзонов. В результате создается молекула трансляционной иРНК. Этот процесс является частью посттранскрипционной модификации РНК. РНК-сплайсинг в основном двухступенчатый процесс. Сначала происходит разрыв в точке 5'-сплайсингового стыка (см. Сплайсинга стык), в точке соединения между экзоном 1 и интроном, и образуется 5'-экзон и лариатная форма (см. Лариат) интрона плюс 3'-экзон. Затем 5'- и 3'-экзоны лигируют, а интронный лариат полностью вырезается. Обе реакции катализируются сплайсосомами.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > splicing
-
5 Georgiev's hypothesis
Гипотеза Георгиева — гипотеза, согласно которой гетерогенная ядерная РНК является продуктом транскрипции структурных генов (см. Гены структурные), а гетерогенность возникает, в частности, при расщеплении длинных полицистронных (см. Цистрон) транскриптов в результате процессинга (см. РНК-процессинг). Г. Г. выдвинута в 1969 г. в противовес гипотезе Бриттена-Дэвидсона (см. Бриттена-Дэвидсона гипотеза) и подтверждена экспериментально.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Georgiev's hypothesis
-
6 processing pro-mRNA
Процессинг про-иРНК — образование зрелой иРНК (см. РНК информационная) из предшественника РНК гетерогенной ядерной РНК (см. Пре-информационная РНК).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > processing pro-mRNA
-
7 processing
Комплекс процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке; включает ряд последовательных расщеплений молекулы-предшественника эндонуклеазой или протеазами с образованием конечных, функционально активных продуктов (например, 41S-, 32S-, 20S-рРНК у многих эукариот - промежуточные; 7S-, 28S-, 18S-рРНК - конечные) и деградации «избыточных» участков; у эукариот П. мРНК включает этап вырезания интронов и образования зрелой молекулы в результате сплайсинга splicing; также к системе П. относят различные модификации - например, метилирование methylation отдельных оснований и др.* * *Процессинг, редактирование1. Посттранскрипционная модификация первичного транскрипта.2. Посттрансляционная модификация белков.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > processing
-
8 processing
обработка
Действие, направленное на изменение свойств предмета труда при выполнении технологического процесса.
[ГОСТ 3.1109-82]
обработка
В экономико-математической литературе этот термин имеет более широкий смысл, чем обычно: он не обязательно означает физический процесс переработки сырья, полуфабрикатов и т.п., но включает также хранение, транспортировку, продажу и другие операции.
[ http://slovar-lopatnikov.ru/]Тематики
EN
DE
FR
обработка (главным образом химическая или термическая)
—
[ http://slovarionline.ru/anglo_russkiy_slovar_neftegazovoy_promyishlennosti/]Тематики
EN
процессинг
Комплекс процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке; включает ряд последовательных расщеплений молекулы-предшественника эндонуклеазой или протеазами с образованием конечных, функционально активных продуктов (например, 41S-, 32S-, 20S-рРНК у многих эукариот - промежуточные; 7S-, 28S-, 18S-рРНК - конечные) и деградации «избыточных» участков; у эукариот П. мРНК включает этап вырезания интронов и образования зрелой молекулы в результате сплайсинга; также к системе П. относят различные модификации - например, метилирование отдельных оснований и др.
[Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]Тематики
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > processing
-
9 RNA processing
процессинг РНК -
10 ribonuclease P
Прокариотический фермент (например, известен у E.coli и Bacillus subtilis); состоит из белкового компонента и РНК, которая в 5 раз превышает по массе белковый компонент; Р.P осуществляет процессинг предшественников тРНК, при этом РНК-компонент Р.P сам по себе обладает каталитической активностью, а белковый компонент без РНК не активен.* * *Рибонуклеаза Р — прокариотический фермент, состоящий из белкового компонента и РНК, каталитическая активность которого зависит от молекулы РНК (см. Рибозимы). Р. Р была открыта как первая РНК, проявляющая свойства истинного фермента, т. е. она действует каталитически, но сама не изменяется и не расходуется в течение реакции. Фермент расщепляет молекулы — предшественники тРНК (см. РНК транспортная), образуя зрелые молекулы тРНК. РНКовый компонент Р. Р по молекулярному весу почти в 5 раз больше, чем белковый, при этом в отличие от белкового он сам по себе может проявлять каталитические функции. Р. Р обнаружена у E. coli и у Bacillus subtilis.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > ribonuclease P
-
11 preribosomal (ribosomal precursor) RNA
предшественник рибосомной РНК
прерибосомная РНК
Гигантская молекула РНК, образуемая при транскрипции генов рРНК; константа седиментации П.р.РНК, например, составляют 38S у дрозофилы, 40S у шпорцевой лягушки, 45S в клетках HeLa; П.р.РНК претерпевают посттранскрипционный процессинг с образованием молекул зрелых рРНК.
[Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]Тематики
Синонимы
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > preribosomal (ribosomal precursor) RNA
-
12 preribosomal (ribosomal precursor) RNA
предшественник рибосомной РНК, прерибосомная РНКГигантская молекула РНК, образуемая при транскрипции генов рРНК; константа седиментации П.р.РНК, например, составляют 38S у дрозофилы, 40S у шпорцевой лягушки, 45S в клетках HeLa HeLa cells; П.р.РНК претерпевают посттранскрипционный процессинг с образованием молекул зрелых рРНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > preribosomal (ribosomal precursor) RNA
-
13 preribosomal (ribosomal precursor) RNA
предшественник рибосомной РНК, прерибосомная РНКГигантская молекула РНК, образуемая при транскрипции генов рРНК; константа седиментации П.р.РНК, например, составляют 38S у дрозофилы, 40S у шпорцевой лягушки, 45S в клетках HeLa HeLa cells; П.р.РНК претерпевают посттранскрипционный процессинг с образованием молекул зрелых рРНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > preribosomal (ribosomal precursor) RNA
-
14 viroids
Вироиды — однонитчатые ковалентно-замкнутые кольцевые молекулы РНК размером в 270-380 нуклеотидов, вызывающие болезни у растений (напр., веретеновидность клубней картофеля). В. не интегрируют в геном хозяина и реплицируются (см. Репликация) как РНК, т. е. напрямую. Механизм вызывания болезни В. пока не ясен. Возможно, что они вмешиваются в процессинг прорибосомной РНК хозяйской клетки. В. имеют некоторую гомологию (сходство) с интронами I группы, что указывает на возможность их происхождения из интронов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > viroids
-
15 ribonuclease P
рибонуклеаза P
Прокариотический фермент (например, известен у E.coli и Bacillus subtilis); состоит из белкового компонента и РНК, которая в 5 раз превышает по массе белковый компонент; Р.P осуществляет процессинг предшественников тРНК, при этом РНК-компонент Р.P сам по себе обладает каталитической активностью, а белковый компонент без РНК не активен.
[Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]Тематики
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > ribonuclease P
-
16 post-transcriptional processing
посттранскрипционный процессинг
Структурная модификация молекул РНК после транскрипции
[ http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech_Eng-Rus.pdf]Тематики
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > post-transcriptional processing
-
17 nRNA
Ядерная РНК, яРНК — РНК, остающаяся внутри ядра после синтеза или экспортируемая в цитоплазму только после процессинга. Напр., гетерологичная яРНК, включая первичные транскрипты многих генов (пре-иРНК, пре-тРНК, пре-рРНК), встречается только в ядре. Процессинг транскриптов (иРНК, тРНК, рРНК), связанный с особыми белками, заканчивается транспортом их в цитоплазму. -
18 nuclear RNA
Ядерная РНК, яРНК — РНК, остающаяся внутри ядра после синтеза или экспортируемая в цитоплазму только после процессинга. Напр., гетерологичная яРНК, включая первичные транскрипты многих генов (пре-иРНК, пре-тРНК, пре-рРНК), встречается только в ядре. Процессинг транскриптов (иРНК, тРНК, рРНК), связанный с особыми белками, заканчивается транспортом их в цитоплазму.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > nuclear RNA
-
19 processing
ˈprəusesɪŋ сущ.
1) обработка America sent cotton to England for processing. ≈ Америка посылает хлопок в Англию для обработки. processing industry ≈ обрабатывающая промышленность food processing industry ≈ пищевая промышленность
2) обработка данных automatic data processing ≈ автоматическая обработка данных Syn: data processing обработка - * industries обрабатывающая промышленность - * tax (американизм) налог на (сельскохозяйственные) товары, подвергнутые обработке - demand * (компьютерное) обработка (данных) по мере поступления переработка (особенно первичная переработка сырья) - food * industry пищевая промышленность стерилизация (при консервировании) технология - * equipment технологическое оборудование (экономика) (компьютерное) обработка (собранных) данных (экономика) (компьютерное) обработка (документации) (кинематографический) лабораторная обработка кинопленки - reversal * процесс обработки с обращением (американизм) оформление( визы, документов) (американизм) рассмотрение( заявления, кандидатуры) (биохимия) процессинг (соединение генов в молекулу РНК) administrative data ~ обработка данных для административного управления background ~ вчт. выполнение работ с низким приоритетом background ~ вчт. фоновая обработка batch ~ вчт. групповая обработка batch ~ вчт. пакетная обработка batch ~ вчт. пакетная обработка данных business data ~ обработка коммерческой информации business ~ обработка деловой информации cheque ~ обработка чеков communications ~ вчт. обработка данных поступающих по линии связи concurrent ~ вчт. параллельное выполнение continuous ~ вчт. непрерывная обработка conversational ~ вчт. диалоговая обработка cooperative ~ вчт. коллективная обработка данных data ~ обработка данных data ~ вчт. обработка данных demand ~ вчт. обработка по мере поступления distributed ~ вчт. распределенная обработка electronic data ~ вчт. электронная обработка данных file ~ вчт. обработка файлов foreground ~ вчт. выполнение работ с высоким приоритетом further ~ последующая обработка image ~ вчт. обработка изображений information ~ обработка данных information ~ вчт. обработка информации information ~ обработка информации integrated data ~ вчт. комплексная обработка данных interactive data ~ вчт. интерактивная обработка данных interactive ~ вчт. диалоговая обработка knowledge ~ вчт. обработка знаний list ~ вчт. обработка списков machine ~ машинная обработка material ~ обработка материалов mechanical ~ механическая обработка multiple ~ вчт. мульти- программирование natural language ~ вчт. обработка естественного языка off-line ~ вчт. автономная обработка on-line ~ вчт. неавтономная обработка on-line ~ вчт. оперативная обработка order ~ обработка заказа parallel ~ вчт. параллельная обработка picture ~ вчт. обработка рисунков priority ~ вчт. обработкая данных в соответствии с приоритетом priority ~ вчт. приоритетная обработка processing pres. p. от process ~ вчт. обрабатывающий ~ обработка;
automatic data processing автоматическая обработка данных ~ вчт. обработка ~ обработка данных ~ оформление документов ~ переработка ~ переработка продуктов ~ технологический процесс ~ технология ~ of cases рассмотрение обстоятельств дела ~ of complaint рассмотрение жалобы ~ of loan оформление ссуды real time ~ вчт. обработка в реальном времени real-time data ~ вчт. обработка данных в реальном масштабе времени real-time data ~ вчт. обработка данных в темпе их поступления real-time ~ вчт. обработка данных в реальном масштабе времени real-time ~ вчт. обработка данных в темпе их поступления remote ~ вчт. телеобработка serial ~ вчт. последовательная обработка signal ~ вчт. обработка сигналов signal ~ вчт. прием сигнала substantive ~ материальное оформление symbolic ~ вчт. обработка символьной информации text ~ вчт. обработка текста time-bound ~ вчт. срочная обработка word ~ вчт. обработка текстов word ~ вчт. подготовка текстов word ~ вчт. пословная обработкаБольшой англо-русский и русско-английский словарь > processing
-
20 processing
[ʹprəʋsesıŋ] n1. 1) обработкаprocessing tax - амер. налог на (сельскохозяйственные) товары, подвергнутые обработке
demand processing - вчт. обработка ( данных) по мере поступления
2) переработка (особ. первичная переработка сырья)3) стерилизация ( при консервировании)2. технология3. 1) эк., вчт. обработка (собранных) данных (тж. data processing)2) обработка (документации и т. п.)4. кино лабораторная обработка киноплёнки5. преим. амер.1) оформление (визы, документов и т. п.)2) рассмотрение (заявления, кандидатуры и т. п.)6. биохим. процессинг ( соединение генов в молекулу РНК)
- 1
- 2
См. также в других словарях:
РНК-процессинг — * РНК працэсінг * RNA processing … Генетика. Энциклопедический словарь
Процессинг РНК — (посттранскрипционные модификации РНК) совокупность процессов в клетках эукариот, которые приводят к превращению первичного транскрипта РНК в зрелую РНК. Наиболее известен процессинг матричных РНК, которые во время своего синтеза… … Википедия
Процессинг про-иРНК — * працэсінг праіРНК * processing pro mRNA образование зрелой иРНК () из предшественника РНК гетерогенной ядерной РНК () … Генетика. Энциклопедический словарь
ПРОЦЕССИНГ — (англ. processing обработка, переработка, от лат. procedo прохожу, продвигаюсь), совокупность реакций, ведущих к превращению первичных продуктов транскрипции и трансляции в функционирующие молекулы. П. подвергаются функционально неактивные… … Биологический энциклопедический словарь
процессинг РНК — Процесс созревания эукариотической РНК [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN RNA processing … Справочник технического переводчика
процессинг — Комплекс процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке; включает ряд последовательных расщеплений молекулы предшественника эндонуклеазой или протеазами с образованием конечных, функционально активных продуктов (например, 41S , 32S ,… … Справочник технического переводчика
РНК-интерференция — Доставка малых РНК, содержащих шпильки, при помощи вектора на основе лентивируса и механизм РНК интерференции в клетках млекопитающих РНК интерференция (а … Википедия
РНК — Пре мРНК со стеблем петлёй. Атомы азота в основаниях выделены голубым, кислорода в фосфатном остове молекулы красным Рибонуклеиновые кислоты (РНК) нуклеиновые кислоты, полимеры нуклеотидов, в состав которых входят остаток ортофосфорной кислоты … Википедия
РНК (биология) — Пре мРНК со стеблем петлёй. Атомы азота в основаниях выделены голубым, кислорода в фосфатном остове молекулы красным Рибонуклеиновые кислоты (РНК) нуклеиновые кислоты, полимеры нуклеотидов, в состав которых входят остаток ортофосфорной кислоты … Википедия
Процессинг (биология) — Схема синтеза белка рибосомой Биосинтез белка сложный многостадийный процесс синтеза полипептидной цепи из аминокислотных остатков, происходящий на рибосомах клеток живых организмов с участием молекул иРНК и тРНК. Содержание 1 Введение … Википедия
РНК — Термин РНК Термин на английском RNA Синонимы рибонуклеиновая кислота, ribonucleic acid Аббревиатуры Связанные термины доставка генов, белки, биологические нанообъекты, биомиметика, генная инженерия, геном, ДНК, ДНК микрочип, клетка, нанолекарство … Энциклопедический словарь нанотехнологий