-
1 expression of polymerase chain reaction
Экспрессия ПЦР — техника, объединяющая ПЦР, или полимеразную цепную реакцию, с транскрипцией и трансляцией in vitro определенного фрагмента ДНК (гена) с тем, чтобы получить амплифицированный продукт (белок) (см. Амплификация). Для этого интересующий ген сначала амплифицируют с помощью ген-специфичного смыслового и антисмыслового праймеров. 5'-конец смыслового праймера содержит область из 12 перекрывающихся п. о. После процедуры амплификации этот участок удлиняется с помощью Taq-полимеразы путем присоединения экспрессионной кассеты, содержащей сайт инициации транскрипции для Т 7 РНК-полимеразы, 5'-нетранслируемую лидерную последовательность из вирусного гена и стартовый кодон ATG. Лидерная последовательность, в свою очередь, несет сайт для связывания с рибосомами. Затем такая рекомбинантная молекула амплифицируется с помощью универсального и антисмыслового праймеров. Образующийся ПЦР-продукт in vitro транскрибируется в иРНК, а затем транслируется в белок.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > expression of polymerase chain reaction
-
2 PCR-expression
Экспрессия ПЦР — техника, объединяющая ПЦР, или полимеразную цепную реакцию, с транскрипцией и трансляцией in vitro определенного фрагмента ДНК (гена) с тем, чтобы получить амплифицированный продукт (белок) (см. Амплификация). Для этого интересующий ген сначала амплифицируют с помощью ген-специфичного смыслового и антисмыслового праймеров. 5'-конец смыслового праймера содержит область из 12 перекрывающихся п. о. После процедуры амплификации этот участок удлиняется с помощью Taq-полимеразы путем присоединения экспрессионной кассеты, содержащей сайт инициации транскрипции для Т 7 РНК-полимеразы, 5'-нетранслируемую лидерную последовательность из вирусного гена и стартовый кодон ATG. Лидерная последовательность, в свою очередь, несет сайт для связывания с рибосомами. Затем такая рекомбинантная молекула амплифицируется с помощью универсального и антисмыслового праймеров. Образующийся ПЦР-продукт in vitro транскрибируется в иРНК, а затем транслируется в белок.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > PCR-expression
-
3 DNA primase
Фермент, осуществляющий синтез РНК-затравки для последующего синтеза фрагментов Оказаки Okazaki fragments, а также синтез РНК-затравок в процессе синтеза репликативной формы replicative form ДНК бактериофагов; у E.coli кодируется геном dnaG, ее молекулярная масса составляет 60 кД; у эукариот ДНК-п. является субъединицей ДНК-полимеразы DNA polymerase; в отличие от обычных РНК-полимераз ДНК-п. способна использовать в качестве субстрата как рибо-, так и дезоксирибонуклеотиды; образует комплекс с другими ферментами - праймосому primosome.* * *ДНК-праймаза — фермент, осуществляющий синтез РНК-праймера (см. Праймер), необходимого для синтеза фрагментов Оказаки, а также синтез РНК-праймеров в процессе синтеза репликативной формы ДНК бактериофагов. У E. coli ДНК-п. кодируется геном dna C (М. м. 60 кД). У эукариот ДНК-п. — это субъединица αДНК-полимеразы (см. ДНК-зависимая ДНК-полимераза). ДНК-п. отличается от обычных РНК-полимераз тем, что способна использовать в качестве субстрата как рибо-, так и дезоксирибонуклеотиды. Кроме того, ДНК-п. образует праймосому.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > DNA primase
-
4 PCR
* * *Полимеразная цепная реакция, ПЦР — процесс амплификации in vitro, при котором фрагмент ДНК длиной до 15 кб может быть амплифицирован (размножен) до 108 раз (копий). Для этого синтезируются два олигонуклеотида размером в 10-30 нуклеотидов, комплементарных последовательностям на двух концах исследуемой ДНК. Избыточное количество этих двух олигонуклеотидных праймеров (см.; амплимеров) смешивается с геномной ДНК, смесь нагревается для денатурации дуплексов ДНК. При последующем снижении температуры праймеры присоединяются к их геномным гомологам и могут с помощью ДНК-полимеразы удлиниться, т. е. на ДНК-матрице синтезируется вторая цепь. Последовательный процесс (цикл процессов) денатурации, отжига праймера и его удлинения повторяется 20-40 раз. В результате происходит экспоненциальное увеличение копий изучаемой ДНК. За 25 амплификационных циклов количество целевых последовательностей ДНК увеличивается приблизительно в 106 раз. Для синтеза новых цепей ДНК используются термостабильные ДНК-полимеразы (Therminus aquaticus или Taq-полимераза, Pfu-ДНК-полимераза, VentTM-ДНК-полимераза). В н. вр. ПЦР нашла широкое распространение в молекулярной биологии и на ее основе разработано множество методов анализа геномов. Имеет место также инвертированная полимеразная цепная реакция, т. е. модификация обычной ПЦР, позволяющая амплифицировать неизвестные последовательности ДНК, прилежащие к коровой области известной последовательности.
-
5 polymerase chain reaction
Метод амплификации in vitro с помощью ДНК-полимеразы нуклеотидных последовательностей с использованием олигонуклеотидных ДНК-затравок, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК на границах амплифицируемого участка; собственно П.ц.р. представляет собой серию из 3 циклически повторяющихся реакций (20-30 циклов) - денатурация ДНК, отжиг ДНК-затравок и синтез ДНК с каждой из затравок навстречу друг другу с использованием противоположных цепей ДНК в качестве матриц, по завершении каждого цикла количество синтезированного продукта удваивается и происходит увеличение количества анализируемой ДНК в геометрической прогрессии; П.ц.р. позволяет амплифицировать любые последовательности длиной до 5-6 тыс. нуклеотидов, что делает возможным использовать ее для секвенирования, молекулярной ДНК-диагностики, картирования генов (в качестве зондов для гибридизации in situ) и др.* * *Полимеразная цепная реакция, ПЦР — процесс амплификации in vitro, при котором фрагмент ДНК длиной до 15 кб может быть амплифицирован (размножен) до 108 раз (копий). Для этого синтезируются два олигонуклеотида размером в 10-30 нуклеотидов, комплементарных последовательностям на двух концах исследуемой ДНК. Избыточное количество этих двух олигонуклеотидных праймеров (см.; амплимеров) смешивается с геномной ДНК, смесь нагревается для денатурации дуплексов ДНК. При последующем снижении температуры праймеры присоединяются к их геномным гомологам и могут с помощью ДНК-полимеразы удлиниться, т. е. на ДНК-матрице синтезируется вторая цепь. Последовательный процесс (цикл процессов) денатурации, отжига праймера и его удлинения повторяется 20-40 раз. В результате происходит экспоненциальное увеличение копий изучаемой ДНК. За 25 амплификационных циклов количество целевых последовательностей ДНК увеличивается приблизительно в 106 раз. Для синтеза новых цепей ДНК используются термостабильные ДНК-полимеразы (Therminus aquaticus или Taq-полимераза, Pfu-ДНК-полимераза, VentTM-ДНК-полимераза). В н. вр. ПЦР нашла широкое распространение в молекулярной биологии и на ее основе разработано множество методов анализа геномов. Имеет место также инвертированная полимеразная цепная реакция, т. е. модификация обычной ПЦР, позволяющая амплифицировать неизвестные последовательности ДНК, прилежащие к коровой области известной последовательности.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > polymerase chain reaction
-
6 master mix
Общая лексика: мастер-микс (смесь-раствор с концентрацией полимеразы, дезоксинуклеотидтрифосфатов и всех компанентов необходимых для проведения ПЦР, за исключением матрицы и праймеров; в качестве дополнительного пояснения к мастер-микс можно использовать) -
7 amplification fragment
Амплификация полиморфных по длине фрагментов — варьирование по длине фрагментов ДНК, образующихся при полимеразной цепной реакции с использованием специфических или произвольных олигонуклеотидных праймеров и геномной ДНК двух или более особей одного вида. Полиморфизм по длине амплифицированных фрагментов возникает:а) из-за полиморфизма рестрикционных сайтов, когда специфические последовательности для узнавания эндонуклеазой в ДНК одной особи присутствуют, а у другой — нет;б) из-за различий в длине последовательностей ДНК, когда число тандемно расположенных простых повторов в данном сайте варьирует у изучаемых особей;в) когда изменено количество п.о. ДНК в нерестрикционных сайтах. Метод AFLP используют для выявления различий между близкородственными организмами, локализации специфических генов в сложном геноме и при создании генетических карт.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > amplification fragment
-
8 AP-PCR
Полимеразная цепная реакция c произвольными праймерами — модификация стандартного метода ПЦР, позволяющая осуществлять амплификацию целевых последовательностей ДНК с помощью произвольно взятых праймеров, без предварительного знания нуклеотидных последовательностей данного генома. Метод позволяет выявлять полиморфизм между штаммами бактерий и грибов, различными сортами растений.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > AP-PCR
-
9 arbitrarily primed polymerase chain reaction
Полимеразная цепная реакция c произвольными праймерами — модификация стандартного метода ПЦР, позволяющая осуществлять амплификацию целевых последовательностей ДНК с помощью произвольно взятых праймеров, без предварительного знания нуклеотидных последовательностей данного генома. Метод позволяет выявлять полиморфизм между штаммами бактерий и грибов, различными сортами растений.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > arbitrarily primed polymerase chain reaction
-
10 kit
-
11 linear amplification DNA sequencing
Линейной амплифицированной ДНК секвенирование, л. с. при ПЦР — техника секвенирования нативной двунитчатой ДНК после ее амплификации методом полимеразной цепной реакции. Очищенную ДНК и меченый по 5'-концу секвенирующий праймер смешивают с четырьмя реакционными средами для секвенирования по Сэнгеру и добавляют Taq ДНК-полимеразу (см. Taq-полимераза). Реакционные смеси помещаются в амплификатор и по заданной температурной программе осуществляется многократная денатурация и отжиг матричной ДНК и праймеров. Удлинение праймера Taq-полимеразой идет до тех пор, пока инкорпорированный дидезоксинуклеотидтрифосфат не остановит реакцию. В результате образуется серия амплифицированных фрагментов, которые могут быть разделены электрофоретически (см. Электрофорез) на специальном гелед ля секвенирования. Метод позволяет определять до 500 и более оснований за один цикл, не требует большого количества ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > linear amplification DNA sequencing
-
12 linear polymerase chain reaction sequencing
Линейной амплифицированной ДНК секвенирование, л. с. при ПЦР — техника секвенирования нативной двунитчатой ДНК после ее амплификации методом полимеразной цепной реакции. Очищенную ДНК и меченый по 5'-концу секвенирующий праймер смешивают с четырьмя реакционными средами для секвенирования по Сэнгеру и добавляют Taq ДНК-полимеразу (см. Taq-полимераза). Реакционные смеси помещаются в амплификатор и по заданной температурной программе осуществляется многократная денатурация и отжиг матричной ДНК и праймеров. Удлинение праймера Taq-полимеразой идет до тех пор, пока инкорпорированный дидезоксинуклеотидтрифосфат не остановит реакцию. В результате образуется серия амплифицированных фрагментов, которые могут быть разделены электрофоретически (см. Электрофорез) на специальном гелед ля секвенирования. Метод позволяет определять до 500 и более оснований за один цикл, не требует большого количества ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > linear polymerase chain reaction sequencing
-
13 PCR in situ hybridization
ПЦР-гибридизация in situ — вариант ПЦР, т.е. полимеразной цепной реакции, когда ДНК амплифицируется и выявляется на морфологически интактных клетках или тканях. Для этого клетки или ткань фиксируются, закрепляются на предметном стекле для микроскопирования и обрабатываются протеазой. Затем добавляются все необходимые для ПЦР реагенты, стекло помещается прямо на термоблок амплификатора, добавляется Taq-полимераза и слайд покрывается минеральным маслом. Амплифицированный продукт может быть выявлен гибридизацией in situ или прямым инкорпорированием (включением) в продукт ПЦР нуклеотидов, меченных биотином или дигоксигенином (см. Дигоксигенином мечение). При этом методе в качестве праймеров используют множественные перекрывающиеся праймеры или конкатамеры.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > PCR in situ hybridization
-
14 primer
Праймер, затравка — короткий олигонуклеотид ДНК или РНК, комплементарный участку более длинной молекулы ДНК или РНК. К его 3'-OH-концу ДНК-полимераза может добавлять нуклеотиды в растущую цепь ДНК в 5'-3'-направлении. У прокариот РНК-полимераза катализирует синтез таких РНК-праймеров для репликации ДНК. П. также нужны для РНК-зависимой ДНК-полимеразы ( обратной транскриптазы, см). In vitro используются синтетические П. размером до 10 п. о. для реакции полимеризации ДНК с помощью ДНК-полимеразы или обратной транскриптазы. П. нужны для синтеза кДНК, ДНК секвенирования по Сэнгеру, ПЦР и др.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > primer
-
15 random amplified polymorphic DNA
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > random amplified polymorphic DNA
-
16 RAPD
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт. -
17 RNA primase
Праймаза РНК — ДНК-зависимая РНК-полимераза из E.coli, катализирующая полимеризацию РНК-праймеров, которые необходимы при репликации ДНК для синтеза запаздывающей цепи. Наряду с др. белками П. РНК является частью праймосомы.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RNA primase
-
18 transfer RNA genes
Транспортной РНК гены — гены, кодирующие транспортную РНК. У эукариот эти гены транскрибируются ДНК-зависимой РНК-полимеразой III и присутствуют в многочисленных копиях. Так, у дрожжей встречаются 5, у дрозофилы — 10, у человека — 15, а у Xenopus — более 200 копий Т.РНК г. на гаплоидный геном. Гены тРНК выполняют и др. функции:а) в компактном митохондриальном геноме млекопитающих они разделяют др. гены и служат маркерными точками для процессинга ;б) структуры, подобные генам тРНК, в ретровирусных геномах выполняют роль праймеров для копирования генетической информации этих вирусов;в) у дрожжей Saccharomyces cerevisiae эти гены часто связаны с транспозонами.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > transfer RNA genes
-
19 tRNA genes
Транспортной РНК гены — гены, кодирующие транспортную РНК. У эукариот эти гены транскрибируются ДНК-зависимой РНК-полимеразой III и присутствуют в многочисленных копиях. Так, у дрожжей встречаются 5, у дрозофилы — 10, у человека — 15, а у Xenopus — более 200 копий Т.РНК г. на гаплоидный геном. Гены тРНК выполняют и др. функции:а) в компактном митохондриальном геноме млекопитающих они разделяют др. гены и служат маркерными точками для процессинга ;б) структуры, подобные генам тРНК, в ретровирусных геномах выполняют роль праймеров для копирования генетической информации этих вирусов;в) у дрожжей Saccharomyces cerevisiae эти гены часто связаны с транспозонами.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > tRNA genes
-
20 random primer method
Англо-русский словарь по биотехнологиям > random primer method
См. также в других словарях:
Полимеразная цепная реакция — (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе). Помимо амплификации ДНК, ПЦР… … Википедия
ДНК-маркер — Рис.1 Электрофорез ПЦР продуктов в агарозном геле и окрашенных бромистым этидием, полученных методом IRAP амплификации. Левая дорожка ДНК известной длины (от 900 до 3000 пар нуклеотидов) … Википедия
ПЦР — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Полимеразная цепная — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Виртуальная ПЦР — Виртуальная полимеразная цепная реакция (in silico ПЦР, цифровая ПЦР, электронная ПЦР, е ПЦР) математический метод компьютерного анализа теоретической полимеразной цепной реакции, используя список последовательностей праймеров (или проб)… … Википедия
FastPCR — FastPCR … Википедия
полимеразная цепная реакция — Термин полимеразная цепная реакция Термин на английском polymerase chain reaction Синонимы Аббревиатуры ПЦР, PCR Связанные термины ДНК, РНК, олигонуклеотид, плазмида Определение Полимеразная цепная реакция экспериментальный метод молекулярной… … Энциклопедический словарь нанотехнологий
Мутагенез — Мутагенез это внесение изменений в нуклеотидную последовательность ДНК (мутаций). Различают естественный (спонтанный) и искусственный (индуцированный) мутагенез. Содержание 1 Естественный мутагенез … Википедия
Аллелоспецифическая полимеразная цепная реакция аллель-с ПцР — Аллелоспецифическая полимеразная цепная реакция, аллель с. ПцР * алеласпецыфічная полімеразная ланцуговая рэакцыя, алель с. ПЛР * allele specific polymerase chain reaction or AS PCR амплификация определенных аллелей, или вариантов… … Генетика. Энциклопедический словарь
Амплификация (молекулярная биология) — Эта статья слишком короткая. Пожалуйста … Википедия
Асимметричная мультиплексная полимеразная цепная реакция — Асимметричная мультиплексная полимеразная цепная реакция: полимеразная цепная реакция, где в одной пробирке с участием нескольких пар праймеров одновременно амплифицируются разные последовательности анализируемой ДНК, причем количество одного из… … Официальная терминология
