-
1 DNA primer
-
2 primer DNA
Короткая одноцепочечная молекула ДНК, используемая ДНК-полимеразами для инициации синтеза ДНК, - например, у парвовирусов (parvoviruses).* * *Праймерная ДНК, ДНК-праймер — короткий однонитчатый фрагмент ДНК, необходимый для ДНК-репликации ДНК-полимеразой III (см. ДНК-полимеразы).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > primer DNA
-
3 DNA primer
Праймерная ДНК, ДНК-праймер — короткий однонитчатый фрагмент ДНК, необходимый для ДНК-репликации ДНК-полимеразой III (см. ДНК-полимеразы).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > DNA primer
-
4 DNA primer
Биология: ДНК-затравка, ДНК-праймер -
5 DNA primase
Фермент, осуществляющий синтез РНК-затравки для последующего синтеза фрагментов Оказаки Okazaki fragments, а также синтез РНК-затравок в процессе синтеза репликативной формы replicative form ДНК бактериофагов; у E.coli кодируется геном dnaG, ее молекулярная масса составляет 60 кД; у эукариот ДНК-п. является субъединицей ДНК-полимеразы DNA polymerase; в отличие от обычных РНК-полимераз ДНК-п. способна использовать в качестве субстрата как рибо-, так и дезоксирибонуклеотиды; образует комплекс с другими ферментами - праймосому primosome.* * *ДНК-праймаза — фермент, осуществляющий синтез РНК-праймера (см. Праймер), необходимого для синтеза фрагментов Оказаки, а также синтез РНК-праймеров в процессе синтеза репликативной формы ДНК бактериофагов. У E. coli ДНК-п. кодируется геном dna C (М. м. 60 кД). У эукариот ДНК-п. — это субъединица αДНК-полимеразы (см. ДНК-зависимая ДНК-полимераза). ДНК-п. отличается от обычных РНК-полимераз тем, что способна использовать в качестве субстрата как рибо-, так и дезоксирибонуклеотиды. Кроме того, ДНК-п. образует праймосому.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > DNA primase
-
6 DNA-dependent RNA polymerase
Фермент, осуществляющий ДНК-зависимый синтез РНК DNA-dependent RNA synthesis; у прокариот существует 2 типа ДНК-з.РНК-п.: ДНК-праймаза DNA primase катализирует синтез РНК-затравки для фрагментов Оказаки Okazaki fragments при репликации ДНК, в то время как РНК-полимераза синтезирует все остальные клеточные РНК; у эукариот все типы клеточных РНК (мРНК mRNA, тРНК tRNA, рРНК rRNA) синтезируются разными ДНК-з.РНК-п.; была открыта у нескольких эу- и прокариотических организмов (в частности, у E.coli) С.Вайсом с соавт. в 1960.* * *ДНК-зависимая РНК-полимераза — фермент, с участием которого происходит ДНК-зависимый синтез РНК. У прокариот существует 2 типа ДНК-з. РНК-п.: ДНК-праймаза катализирует синтез РНК-праймера (см. Праймер) для фрагментов Оказаки при репликации ДНК, а РНК-полимераза в это время синтезирует все остальные клеточные РНК. У эукариот все типы клеточных РНК (иРНК, тРНК, рРНК) синтезируются разными ДНК-з. РНК-п. Данный фермент открыт у нескольких эу- и прокариотических (E. coli, напр.) организмов С. Вайсом с соавт. в 1960 г. (ср. РНК-зависимая ДНК-полимераза).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > DNA-dependent RNA polymerase
-
7 primer
Праймер, затравка — короткий олигонуклеотид ДНК или РНК, комплементарный участку более длинной молекулы ДНК или РНК. К его 3'-OH-концу ДНК-полимераза может добавлять нуклеотиды в растущую цепь ДНК в 5'-3'-направлении. У прокариот РНК-полимераза катализирует синтез таких РНК-праймеров для репликации ДНК. П. также нужны для РНК-зависимой ДНК-полимеразы ( обратной транскриптазы, см). In vitro используются синтетические П. размером до 10 п. о. для реакции полимеризации ДНК с помощью ДНК-полимеразы или обратной транскриптазы. П. нужны для синтеза кДНК, ДНК секвенирования по Сэнгеру, ПЦР и др.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > primer
-
8 primer
* * *праймеркороткая последовательность молекулы ДНК, использующаяся для инициации синтеза специфического фрагмента при полимеразной цепной реакции -
9 targeted gene walking polymerase chain reaction
Шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена — вариант обычной полимеразной цепной реакции (см.) для амплификации (см.) неизвестной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз (влево или вправо) от известной последовательности. Для этого первый последовательность-специфический ПЦР-праймер (целевой праймер, т.е. комплементарный экзону) и второй специфический праймер (внутренний праймер, гибридизующийся с той же нитью ДНК и расположенный близко к сайту целевого праймера) отжигаются (гибридизуются) к их целевым сайтам (мишеням) в геноме. Затем неспецифические, т.н. "шагающие" праймеры, комплементарные к последовательностям, расположенным выше или ниже мишени и сайта связывания внутреннего праймера, используются для амплификации расположенных между ними районов с помощью <I>Taq</I> ДНК-полимеразы (см. <I> полимераза Taq -полимераза </I>). Эту технику можно применять для изоляции последовательностей, прилежащих к уже известным районам без процедуры клонирования (см.) и выделения, а также для ДНК-фингерпринтинга (см.), обнаружения регуляторных районов и изолирования генов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > targeted gene walking polymerase chain reaction
-
10 Senger sequencing (enzymatic method)
Секвенирование по Сэнгеру (ферментативный метод) — техника секвенирования однонитчатой ДНК. В основе метода — присоединение ( отжиг, см.) к однонитчатой ДНК-мишени секвенирующего праймера (см. Праймер) или обратного секвенирующего праймера (обычно синтетических олигонуклеотидов). Реакционная смесь переносится в 4 пробирки, куда добавляются все 4 дезоксинуклеозидтрифосфата, один из которых мечен по 32P. Каждая пробирка содержит различные дидезоксинуклеозидтрифосфаты (ддАТФ, ддСТФ, ддГТФ и ддТТФ). Для синтеза комплементарной копии к однонитчатой последовательности-мишени в пробирки добавляется фрагмент Кленова (см. Кленова фрагмент). В результате происходит удлинение праймера в соответствии с матричной последовательностью. Когда в растущую цепь вместо соответствующего дНТФ в матрице включается ддМТФ, 3'-конец растущей цепи теряет гидроксильную группу и не может дальше удлиняться: цепь терминируется. В итоге каждая реакционная смесь получит популяцию радиоактивно меченных фрагментов ДНК с общим 5'-концом (праймер), но с разными 3'-концами. После окончания реакции ДНК денатурируется, подвергается электрофорезу в тонкослойном полиакриламидном геле (см. Секвенирующий гель) и с помощью радиоавтографии выявляются радиоактивные полосы. Последовательность нуклеотидов в исходной ДНК-мишени может затем прочитываться прямо с радиоавтограммы.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Senger sequencing (enzymatic method)
-
11 Senger sequencing (enzymatic method)
Секвенирование по Сэнгеру (ферментативный метод) — техника секвенирования однонитчатой ДНК. В основе метода — присоединение ( отжиг, см.) к однонитчатой ДНК-мишени секвенирующего праймера (см. Праймер) или обратного секвенирующего праймера (обычно синтетических олигонуклеотидов). Реакционная смесь переносится в 4 пробирки, куда добавляются все 4 дезоксинуклеозидтрифосфата, один из которых мечен по 32P. Каждая пробирка содержит различные дидезоксинуклеозидтрифосфаты (ддАТФ, ддСТФ, ддГТФ и ддТТФ). Для синтеза комплементарной копии к однонитчатой последовательности-мишени в пробирки добавляется фрагмент Кленова (см. Кленова фрагмент). В результате происходит удлинение праймера в соответствии с матричной последовательностью. Когда в растущую цепь вместо соответствующего дНТФ в матрице включается ддМТФ, 3'-конец растущей цепи теряет гидроксильную группу и не может дальше удлиняться: цепь терминируется. В итоге каждая реакционная смесь получит популяцию радиоактивно меченных фрагментов ДНК с общим 5'-концом (праймер), но с разными 3'-концами. После окончания реакции ДНК денатурируется, подвергается электрофорезу в тонкослойном полиакриламидном геле (см. Секвенирующий гель) и с помощью радиоавтографии выявляются радиоактивные полосы. Последовательность нуклеотидов в исходной ДНК-мишени может затем прочитываться прямо с радиоавтограммы.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Senger sequencing (enzymatic method)
-
12 RNA primer
РНК-праймер — короткий олигонуклеотид длиной в 10 — 15 нуклеотидов, который синтезируется РНК-праймазой (см. Праймаза РНК), присоединяется к запаздывающей цепи с интервалом в 200 п. о. и служит как стартовая молекула (праймер, см.) в синтезе фрагментов Оказаки (см. Оказаки фрагменты). После синтеза соседних фрагментов Оказаки РНК-п. удаляется ДНК-полимеразой (репарационная функция 5'-3'-экзонуклеазы) и замещается ДНК. Разрывы между сегментами ДНК затем ковалентно закрываются ДНК-лигазой.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RNA primer
-
13 primer RNA
Олигорибонуклеотид, синтезируемый с участием РНК-полимеразы или ДНК-праймазы DNA primase: с 5'-конца РНК-з. с участием ДНК-полимеразы III инициируется синтез новой молекулы ДНК (или фрагмента Оказаки Okazaki fragments), после чего РНК-з. отщепляется, образующаяся брешь одновременно застраивается ДНК-полимеразой I, а одноцепочечные разрывы nick репарируются ДНК-лигазой DNA ligase.* * *Праймерная РНК — короткая последовательность РНК, синтезированная праймазой с матричной нити ДНК и служащая как необходимый праймер, к которому ДНК-полимераза присоединяет дезоксирибонуклеотиды в течение репликации ДНК. Позднее праймеры ферментативно выводятся, гэпы закрываются ДНК-полимеразой I, а оставшиеся ники закупориваются лигазой.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > primer RNA
-
14 RNA polymerase
РНК-полимераза, РНК-синтетазаФермент, осуществляющий матричный синтез РНК из рибонуклеозидтрифосфатов; в зависимости от используемой матрицы - ДНК или РНК - различают ДНК-зависимую DNA-dependent RNA polymerase и РНК-зависимую РНК-п. RNA-dependent RNA polymerase; у прокариот имеется 2 типа РНК-п.: одна из них синтезирует РНК-затравки для фрагментов Оказаки Okazaki fragments, а другая - все остальные типы РНК; у эукариот - 3 типа РНК-п.: РНК-п.I осуществляет синтез рРНК ribosomal RNA, РНК-п.II синтезирует мРНК mRNA, а РНК-п.III - тРНК transfer RNA, 5S-РНК и др. небольшие РНК; активность РНК-п. может полностью подавляться некоторыми антибиотиками - например, рифамицином rifamycins и актиномицином D actinomycin D (бактериальная РНК-п.), альфа-аманитином alpha-amanitin (РНК-п.II прокариот).* * *РНК-полимераза, РНК-синтетаза1. ДНК-зависимая РНК-полимераза — фермент, катализирующий образование РНК из рибонуклеозидтрифосфатов и использующий антисмысловую нить двунитчатой ДНК в качестве матрицы. У прокариот существует 2 типа РНК-п.: одна синтезирует РНК-праймер, необходимый для ДНК-репликации, другая транскрибирует структурные гены, а также гены рибосомной и транспортной РНК. У эукариот имеются 3 различающиеся ядерные РНК-п., транскрибирующие рДНК (полимераза IA), 7S ДНК, 5S ДНК, мяДНК (полимераза IIIС) и структурные гены (полимераза IIB).2. РНК-зависимая РНК-полимераза — фермент, катализирующий образование РНК, но использующий РНК в качестве матрицы. Активность РНК-п. может полностью подавляться некоторыми антибиотиками (рифамицином, актиномицином Д) и альфа-аманитином (только РНК-п. II прокариот).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RNA polymerase
-
15 linear amplification DNA sequencing
Линейной амплифицированной ДНК секвенирование, л. с. при ПЦР — техника секвенирования нативной двунитчатой ДНК после ее амплификации методом полимеразной цепной реакции. Очищенную ДНК и меченый по 5'-концу секвенирующий праймер смешивают с четырьмя реакционными средами для секвенирования по Сэнгеру и добавляют Taq ДНК-полимеразу (см. Taq-полимераза). Реакционные смеси помещаются в амплификатор и по заданной температурной программе осуществляется многократная денатурация и отжиг матричной ДНК и праймеров. Удлинение праймера Taq-полимеразой идет до тех пор, пока инкорпорированный дидезоксинуклеотидтрифосфат не остановит реакцию. В результате образуется серия амплифицированных фрагментов, которые могут быть разделены электрофоретически (см. Электрофорез) на специальном гелед ля секвенирования. Метод позволяет определять до 500 и более оснований за один цикл, не требует большого количества ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > linear amplification DNA sequencing
-
16 linear polymerase chain reaction sequencing
Линейной амплифицированной ДНК секвенирование, л. с. при ПЦР — техника секвенирования нативной двунитчатой ДНК после ее амплификации методом полимеразной цепной реакции. Очищенную ДНК и меченый по 5'-концу секвенирующий праймер смешивают с четырьмя реакционными средами для секвенирования по Сэнгеру и добавляют Taq ДНК-полимеразу (см. Taq-полимераза). Реакционные смеси помещаются в амплификатор и по заданной температурной программе осуществляется многократная денатурация и отжиг матричной ДНК и праймеров. Удлинение праймера Taq-полимеразой идет до тех пор, пока инкорпорированный дидезоксинуклеотидтрифосфат не остановит реакцию. В результате образуется серия амплифицированных фрагментов, которые могут быть разделены электрофоретически (см. Электрофорез) на специальном гелед ля секвенирования. Метод позволяет определять до 500 и более оснований за один цикл, не требует большого количества ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > linear polymerase chain reaction sequencing
-
17 RNA synthetase
см. RNA polymerase* * *РНК-полимераза, РНК-синтетаза1. ДНК-зависимая РНК-полимераза — фермент, катализирующий образование РНК из рибонуклеозидтрифосфатов и использующий антисмысловую нить двунитчатой ДНК в качестве матрицы. У прокариот существует 2 типа РНК-п.: одна синтезирует РНК-праймер, необходимый для ДНК-репликации, другая транскрибирует структурные гены, а также гены рибосомной и транспортной РНК. У эукариот имеются 3 различающиеся ядерные РНК-п., транскрибирующие рДНК (полимераза IA), 7S ДНК, 5S ДНК, мяДНК (полимераза IIIС) и структурные гены (полимераза IIB).2. РНК-зависимая РНК-полимераза — фермент, катализирующий образование РНК, но использующий РНК в качестве матрицы. Активность РНК-п. может полностью подавляться некоторыми антибиотиками (рифамицином, актиномицином Д) и альфа-аманитином (только РНК-п. II прокариот).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RNA synthetase
-
18 Pfu DNA polymerase
Pfu-ДНК-полимераза — высокотермостабильная и гиперактивная мономерная ДНК-полимераза с 5'-3'-полимеразной и 3'-5'-эндонуклеазной активностью. Изолирована из сверхтермофильной морской архебактерии Pyrococcus furiosis (Pfu). Фермент используется для ПЦР, считается, что он имеет преимущество перед Taq-полимеразой, поскольку обладает способностью узнавать ошибки спаривания нуклеотидов. Pfu-ДНК-п. может вырезать ошибочные 3'-концевые нуклеотиды из комплекса праймер-матрица и вставлять правильные, комплементарные нуклеотиды. Taq-полимераза не обладает такой активностью.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Pfu DNA polymerase
-
19 random amplified polymorphic DNA
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > random amplified polymorphic DNA
-
20 RAPD
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт.
- 1
- 2
См. также в других словарях:
Праймер — (англ. primer) это короткий фрагмент нуклеиновой кислоты (олигонуклеотид), комплементарный ДНК или РНК мишени, служит затравкой для синтеза комплементарной цепи с помощью ДНК полимеразы, а также при репликации ДНК. Затравка необходима… … Википедия
Праймер затравка — Праймер, затравка * праймер, затраўка * primer короткий олигонуклеотид ДНК или РНК, комплементарный участку более длинной молекулы ДНК или РНК. К его 31 OH концу ДНК полимераза (см.) может добавлять нуклеотиды в растущую цепь ДНК в 51 31… … Генетика. Энциклопедический словарь
Праймер произвольный — * праймер адвольны * arbitrary primer короткий олигонуклеотидный праймер, используемый в определенных ПЦР методах для инициации синтеза ДНК в случайных (произвольных) участках взятой для эксперимента ДНК мишени … Генетика. Энциклопедический словарь
ДНК-праймаза — * ДНК праймаза * DNA primase фермент, осуществляющий синтез РНК праймера (), необходимого для синтеза фрагментов Оказаки, а также РНК праймеров в процессе синтеза репликативной формы ДНК бактериофагов. У E. coli ДНК п. кодируется геном dna C (М.… … Генетика. Энциклопедический словарь
ДНК-зависимая РНК-полимераза — * ДНКзалежная РНК полімераза * DNA dependent RNA polymerase фермент, с участием которого происходит ДНК зависимый синтез РНК (см.). У прокариот существует два типа ДНК з. РНК п.: ДНК праймаза (см.) катализирует синтез РНК праймера () для… … Генетика. Энциклопедический словарь
ДНК-затравка — * ДНК затраўка * primer DNA короткая одноцепочечная молекула ДНК, используемая ДНК полимеразами для инициации синтеза ДНК, напр., у парвовирусов … Генетика. Энциклопедический словарь
праймер — Короткая последовательность молекулы ДНК, использующаяся для инициации синтеза специфического фрагмента при полимеразной цепной реакции [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN primer … Справочник технического переводчика
ДНК-маркер — Рис.1 Электрофорез ПЦР продуктов в агарозном геле и окрашенных бромистым этидием, полученных методом IRAP амплификации. Левая дорожка ДНК известной длины (от 900 до 3000 пар нуклеотидов) … Википедия
ДНК-полимераза — Трёхмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализир … Википедия
ДНК-зависимая ДНК-полимераза — Трехмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализируют полимеризацию дезоксирибонуклеотидов вдоль цепочки… … Википедия
ДНК-полимеразы — Трехмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализируют полимеризацию дезоксирибонуклеотидов вдоль цепочки… … Википедия