-
1 heterogeneous nuclear RNA
гетерогенная ядерная РНК, гяРНКФракция локализованных в ядре молекул РНК, близких по составу к ДНК и гетерогенных по размеру; по крайней мере часть гяРНК является предшественниками цитоплазматических мРНК, содержит соответствующие интронам intron последовательности, образовавшиеся в результате процессинга пре-мРНК, а также малые ядерные РНК snurps (см. Britten-Davidson's hypothesis Georgiev hypothesis).* * *Гетерогенная ядерная РНК, гяРНК — пул экстрахромосомных молекул РНК, обнаруженных в ядре, включая гетерогенную смесь первичных транскриптов, частично транскрибированные молекулы отдельных интронов РНК и малые молекулы ядерной РНК. Термин часто используется для обозначения первичных транскриптов или их модифицированных продуктов (см. Малая ядерная РНК. Сплайсосома).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > heterogeneous nuclear RNA
-
2 hnRNA
* * *Гетерогенная ядерная РНК, гяРНК — пул экстрахромосомных молекул РНК, обнаруженных в ядре, включая гетерогенную смесь первичных транскриптов, частично транскрибированные молекулы отдельных интронов РНК и малые молекулы ядерной РНК. Термин часто используется для обозначения первичных транскриптов или их модифицированных продуктов (см. Малая ядерная РНК. Сплайсосома).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > hnRNA
-
3 T-DNA
Фрагмент ДНК Ti- Ti-plasmid или Ri-плазмиды Ri plasmid, внедряющийся в ядерный геном клетки-хозяина при индукции опухоли ( корончатого галла) и включающий 7 генов; обычно Т-ДНК стабильно наследуется геномом клетки-хозяина.* * *T-ДНК, переносимая ДНК — часть Ti-плазмиды в вирулентной Agrobacterium tumefaciens или Ri-плазмиды в вирулентной Agrobacterium rhizogenes, которая переносится из бактерии в ядерный геном растительных клеток. Там она стабильно интегрирует в геном и экспрессируется, вызывая постоянную пролиферацию (размножение) хозяйских клеток в опухоль (корончато-галловые опухоли или болезнь «бородатый»/«волосатый» корень). Т-ДНК фланкирована прямыми повторами, т.н. Т-ДНК границами, пограничными последовательностями. Пролиферация индуцируется за счет экспрессии 1, 2 и 4-го генов Т-ДНК. Гены 1 и 2 кодируют ферменты, превращающие триптофан в индолацетамид (триптофанмонооксигеназа), а индолацетамид — в индолилуксусную кислоту ( ИУК, см.; индолацетамидгидролаза). Ген 4 кодирует изопентенилтрансферазу, катализирующую синтез растительного гормона цитокинина зеатинового типа. В зависимости от штамма Agrobacterium tumefaciens Т-ДНК может отличаться по характеру опухолеобразования и по генам, кодирующим ферменты, которые катализируют синтез различных опинов. Напр., в т. н. нопалиновых опухолях Т-ДНК присутствует в виде протяженной последовательности в 23 кб, содержащей 13 генов, среди которых есть ген нопалинсинтазы. Он кодирует необычную аминокислоту — нопалин. В опухолях октопинового типа, продуцирующих необычную аминокислоту — октопин, Т-ДНК представлена двумя участками — 12 кб ТL-ДНК (левая) и 7 кб ТR-ДНК (правая), разделенными последовательностями растительной ДНК. ТL-ДНК ответственна за опухолеобразование и образует 8 транскриптов, ТR-ДНК кодирует 5 транскриптов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > T-DNA
-
4 transferred DNA
см. T-DNA* * *T-ДНК, переносимая ДНК — часть Ti-плазмиды в вирулентной Agrobacterium tumefaciens или Ri-плазмиды в вирулентной Agrobacterium rhizogenes, которая переносится из бактерии в ядерный геном растительных клеток. Там она стабильно интегрирует в геном и экспрессируется, вызывая постоянную пролиферацию (размножение) хозяйских клеток в опухоль (корончато-галловые опухоли или болезнь «бородатый»/«волосатый» корень). Т-ДНК фланкирована прямыми повторами, т.н. Т-ДНК границами, пограничными последовательностями. Пролиферация индуцируется за счет экспрессии 1, 2 и 4-го генов Т-ДНК. Гены 1 и 2 кодируют ферменты, превращающие триптофан в индолацетамид (триптофанмонооксигеназа), а индолацетамид — в индолилуксусную кислоту ( ИУК, см.; индолацетамидгидролаза). Ген 4 кодирует изопентенилтрансферазу, катализирующую синтез растительного гормона цитокинина зеатинового типа. В зависимости от штамма Agrobacterium tumefaciens Т-ДНК может отличаться по характеру опухолеобразования и по генам, кодирующим ферменты, которые катализируют синтез различных опинов. Напр., в т. н. нопалиновых опухолях Т-ДНК присутствует в виде протяженной последовательности в 23 кб, содержащей 13 генов, среди которых есть ген нопалинсинтазы. Он кодирует необычную аминокислоту — нопалин. В опухолях октопинового типа, продуцирующих необычную аминокислоту — октопин, Т-ДНК представлена двумя участками — 12 кб ТL-ДНК (левая) и 7 кб ТR-ДНК (правая), разделенными последовательностями растительной ДНК. ТL-ДНК ответственна за опухолеобразование и образует 8 транскриптов, ТR-ДНК кодирует 5 транскриптов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > transferred DNA
-
5 transcript
матрица; транскриптdecapentaplegic transcript — декапентаплегический транскрипт (мРНК из 15 нуклеотидных пар, входящих в семейство TGF-beta-транскриптов)
full-length transcript — первичный [непроцессированный] транскрипт
polycistrone transcript — полигенный [полицистронный] транскрипт ( первичный транскрипт пре-мРНК)
polygenic transcript — полигенный [полицистронный] транскрипт ( первичный транскрипт пре-мРНК)
truncated transcript — процессированный ( укороченный) транскрипт
-
6 cytological hybridization
см. in situ hybridization* * *In situ-гибридизация, цитологическая г. — метод идентификации специфических последовательностей ДНК в интактных хромосомах путем гибридизации с радиоактивно меченным комплементарным зондом. В качестве зонда часто используются синтетические олигонуклеотиды. Для этого биологический материал раздавливается на предметном стекле для микроскопирования, ДНК денатурируется (см. Денатурация) и затем гибридизируется с меченным по тритию зондом. На препарат наслаивается фотографическая эмульсия и на радиоавтографах устанавливается место гибридизации. Гибридизация может также осуществляться с нерадиоактивной меткой (напр., биотинилирование нуклеиновых кислот, см.). In situ-г. широко используется для точной локализации клонированных генов на политенных хромосомах (напр., у дрозофилы), а также для локализации транскриптов специфических генов в клетках и тканях. Данный метод разработан в 1969 г. на материале ооцитов шпорцевой лягушки независимо друг от друга двумя группами исследователей — Г. Джона с сотр. и Дж. Галла и М. Пэрдью.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > cytological hybridization
-
7 Georgiev hypothesis
Экспериментально подтвержденная гипотеза, в соответствии с которой гетерогенная ядерная РНК heterogeneous nuclear RNA является продуктом транскрипции структурных генов, а гетерогенность возникает, в частности, при расщеплении длинных (полицистронных) транскриптов в результате процессинга; противопоставлялась гипотезе Бриттена-Дэвидсона Britten-Davidson's hypothesis, выдвинута Г.П.Георгиевым в 1969.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Georgiev hypothesis
-
8 in situ hybridization
гибридизация in situ, цитологическая гибридизацияМетод выявления (картирования) определенных участков молекулы ДНК - препараты хромосом после денатурации ДНК и удаления РНК и белков гибридизуют с мечеными фрагментами ДНК (или РНК), комплементарными искомому участку, а затем образовавшиеся гибриды (гетеродуплексы) выявляют методом авторадиографии; метод разработан в 1969 независимо двумя группами исследователей - Г.Джона с сотр. и Дж.Галла и М.Пэрдью - на материале ооцитов шпорцевой лягушки.* * *In situ-гибридизация, цитологическая г. — метод идентификации специфических последовательностей ДНК в интактных хромосомах путем гибридизации с радиоактивно меченным комплементарным зондом. В качестве зонда часто используются синтетические олигонуклеотиды. Для этого биологический материал раздавливается на предметном стекле для микроскопирования, ДНК денатурируется (см. Денатурация) и затем гибридизируется с меченным по тритию зондом. На препарат наслаивается фотографическая эмульсия и на радиоавтографах устанавливается место гибридизации. Гибридизация может также осуществляться с нерадиоактивной меткой (напр., биотинилирование нуклеиновых кислот, см.). In situ-г. широко используется для точной локализации клонированных генов на политенных хромосомах (напр., у дрозофилы), а также для локализации транскриптов специфических генов в клетках и тканях. Данный метод разработан в 1969 г. на материале ооцитов шпорцевой лягушки независимо друг от друга двумя группами исследователей — Г. Джона с сотр. и Дж. Галла и М. Пэрдью.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > in situ hybridization
-
9 intron mobility
Способность интрона intron к перемещению между молекулами ДНК или РНК, как это характерно для мобильных генетических элементов transposable elements; П.и. на уровне РНК-транскриптов обнаружена С.Вудсоном и Т.Чехом в 1989 у инфузории Tetrahymena thermophila, а П.и. на уровне ДНК обнаружена в том же году Д.Мускареллой и Ф.Фогтом у Physarum polycephalum; способность к перемещениям характерна интронам группы I introns group I.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > intron mobility
-
10 LTR
* * *Длинный терминальный повтор, ДТП; д. концевой п. — домен, или участок, состоящий из нескольких сот п. о., на концах нуклеиновой кислоты ретровирусов, образовавшихся в результате обратной транскрипции (см. Транскрипция обратная). У провирусов ДТП, расположенный апстрим (см.; верхняя плюсовая), функционирует как промотор или энхансер, а ДТП, расположенный даунстрим (см.; за стоп-кодоном, «вниз по течению»), — как поли(А) дополнительный сигнал. ДТП может использоваться как элемент интеграционного вектора и выполнять функции, являющиеся основными для экспрессии большинства эукариотических генов (напр., перемещение, инициация, полиаденилирование транскриптов). Каждый ДТП состоит из трех элементов -U3-R-U5, длина которых соответственно 170-1250, 10-80 и 80 -100 тыс. нуклеотидов. 3'-конец U5 содержит короткий инвертированный повтор, который гомологичен последовательности на 5'-конце элемента U3, т. е. сама последовательность ДТП фланкирована короткими инвертированными повторами. ДТП участвуют в интегрировании ДНК-копии генома ретровируса в геном клетки-хозяина, кроме того, область U3 каждого ДТП несет промотор, причем промотор левого ДТП участвует в транскрипции ДНК провируса, а промотор правого — в транскрипции последовательности ДНК клетки-хозяина вблизи сайта интеграции ретровируса, что в определенных условиях может приводить к опухолевой трансформации клеток, содержащих ретровирусы. ДТП фланкируют также сложные элементы и участвуют в процессе их транспозиции. -
11 nucleolus
Плотное образование, выявляемое в интерфазных эукариотических клетках: ассоциировано с ядрышковым организатором nucleolar organizer и включает молекулы рибонуклеопротеинов (предшественников рибосом); часто в клетке содержится 1-2 Я., иногда - более 2; Я. может формироваться в цитоплазме на внехромосомных копиях генов рРНК (например, у некоторых инфузорий); Я. включает фибриллярный центр fibrillar center, фибриллярный fibrillar component и гранулярный granular component компоненты.* * *Ядрышко — сферическая или глобулярная полуядерная (subnuclear) органелла, связанная с ядрышковым организатором хромосомы. Я. состоит в основном из первичных рДНК-транскриптов, рибосомных белков и набора др. белков, таких, как РНК-полимераза I (A) и РНК-метилазы, а также включает в себя фибриллярный центр и фибриллярный и гранулярный компоненты. В активном состоянии Я. экспортирует большое количество предшественников рибосом. В основном в клетке имеется 1-2 Я., иногда более двух. Я. может быть сформировано в цитоплазме на внехромосомных копиях генов рРНК (напр., у некоторых инфузорий).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > nucleolus
-
12 plasmosome
см. nucleolus* * *Ядрышко — сферическая или глобулярная полуядерная (subnuclear) органелла, связанная с ядрышковым организатором хромосомы. Я. состоит в основном из первичных рДНК-транскриптов, рибосомных белков и набора др. белков, таких, как РНК-полимераза I (A) и РНК-метилазы, а также включает в себя фибриллярный центр и фибриллярный и гранулярный компоненты. В активном состоянии Я. экспортирует большое количество предшественников рибосом. В основном в клетке имеется 1-2 Я., иногда более двух. Я. может быть сформировано в цитоплазме на внехромосомных копиях генов рРНК (напр., у некоторых инфузорий).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > plasmosome
-
13 retroviruses
ретровирусы, лейковирусыГруппа РНК-содержащих вирусов диаметром 70-120 нм, капсид заключен в липопротеиновую оболочку, каждая частица включает по 2 идентичные молекулы РНК и связанные с ними молекулы обратной транскриптазы reverse transcriptase; многие Р. опухолеродны (вирус саркомы Рауса Rous sarcoma virus, вирусы лейкозов и саркомы мышей, вирус Биттнера и др.); в настоящее время Р. широко используются в качестве векторов vector в генной инженерии для введения чужеродных генов в клетки животных; впервые Р. были описаны В.Эллерманном и Д.Бангом в 1908.* * *Ретровирусы — класс однонитчатых РНКовых вирусов, инфицирующих клетки эукариот, в которых РНК-геном транскрибируется в ДНК-копию (кДНК) с помощью РНК-зависимой ДНК-полимеразы (обратной транскриптазы, см.). Эта двунитчатая кДНК затем закольцовывается (см. ДНК-кольцевание), проникает в ядро клетки и интегрирует в геном с помощью механизма, сходного с механизмом транспозиции. Интегрированный вирусный геном называется провирусом. Длинные концевые повторы содержат энхансер и промотор, а также кодирующие области, несущие gag-ген (кодирует вирусные капсидные белки), pol-ген (кодирует обратную транскриптазу) и env-ген (кодирует гликопротеины вирусной липидной оболочки). Концы вирусного генома несут R-сегменты — прямые повторы длиной 10-80 п. о., фланкируемые последовательностями U5 на 5'-конце длиной 80 -100 нуклеотидов и U3 на 3'-конце длиной от 170 до 1000 и более нуклеотидов. Инфекционный цикл начинается с освобождения вирусной РНК из капсида. Затем происходит обратная транскрипция и интеграция образовавшейся ДНК в геном реципиента. Транскрипция эндогенного ретровирусного генома ведет к накоплению транскриптов, которые транслируются в капсидные белки. В результате соединения вирусной РНК с белками образуются новые вирусные частицы, покидающие затем клетку путем почкования (budding).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > retroviruses
-
14 reverse genetics
«обратная генетика»Современное направление генетики, сочетающее направленные изменения структуры ДНК (мутагенез) с изучением их фенотипического проявления в конкретной биологической тест-системе; одно из важнейших достижений "О.г." — выяснение регуляторной роли связывающихся с ДНК белков (белки «цинковые пальцы» zinc finger proteins и др.).* * *1. Изолирование гена, когда не известен кодируемый им белок или его функции. Этот подход успешно использован при изучении наследственных заболеваний (напр., болезнь хронического гранулематоза и др.). Метод заключается в следующем:а) определение положения гена на карте (см. Генетические карты) с помощью цитогенетических методов совместно с методом полиморфизма длины рестрикционных фрагментов ( ПДРФ, см.);б) выявление искомого гена в пределах области, мутации в которой тесно коррелируют с болезнью, с использованием клонирования и процедуры « прогулки по хромосоме» ;в) поиск РНК-транскриптов и их изучение.2. Современное направление генетики, сочетающее в себе направленные изменения структуры ДНК (см. Мутагенез) с изучением их фенотипического проявления в конкретной биологической тест-системе. Одно из важнейших достижений О. г. — выяснение регуляторной роли связывающихся с ДНК белков (напр., белки «цинковые пальцы» и др.).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > reverse genetics
-
15 RT-PCR
Вариант метода полимеразной цепной реакции polymerase chain reaction, модифицированный для анализа молекул РНК, - на первом этапе метода на матрице тестируемой молекулы мРНК с использованием фермента обратной транскриптазы reverse transcriptase получают одноноцепочечную кДНК, которую затем амплифицируют стандартным ПЦР-методом; внедрение метода RT-PCR позволило изучить мРНК, присутствующие в клетках в очень небольшом количестве, - например, мРНК белков факторов роста в ранних эмбрионах и др.; в настоящее время для этих целей используют термостабильные ДНК-полимеразы, обладающие обратно-транскриптазной активностью (например, синтезируемую Thermus thermophilus).* * *Обратных транскриптов полимеразная цепная реакция, кДНК-ПЦР, РНК-ПЦР — процедура амплификации РНК in vitro с использованием ретровирусной обратной транскриптазы или термостабильной Therminus thermophilus (Tth) ДНК-полимеразы для получения кДНК на матрице РНК. кДНК затем амплифицируется методом обычной ПЦР. Tth-обратная транскриптаза катализирует как обратную транскрипцию в присутствии MnCl2, так и амплификацию образовавшейся кДНК в присутствии MnCl2. Более того, ее каталитическая активность не снижается при повышении реакционной температуры с целью дестабилизации вторичной структуры РНК и эффективного отжига праймера. Т.обр., при использовании Tth-фермента все реакции можно осуществить в одной пробирке. РНК-ПЦР позволяет амплифицировать кДНК с очень малых количеств очищенных иРНК, тРНК, рРНК и вирусных РНК, а также обнаруживать специфические РНК при очень малом количестве копий, поэтому метод применяется для анализа экспрессии генов на уровне РНК. РНК-ПЦР-метод можно использовать также и для одновременного изучения трансляции генов in vitro.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RT-PCR
-
16 splice junction
Сайт соединения крайних нуклеотидов соседних экзона exon и интрона intron, по которому при процессинге мРНК происходит ее разрезание с последующим сплайсингом splicing экзонных последовательностей нуклеотидов.* * *Сплайсинга стык, граница с. — консенсусная последовательность на концах интронов, которая участвует в реакциях вырезания и сращивания в период посттранскрипционной модификации первичных транскриптов эукариотических генов, разделенных интронами. Стыковой сигнал на 5'-конце интронного транскрипта является донорным сплайсинговым стыком, а сигнал на 3'-конце — акцепторным сплайсинговым стыком.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > splice junction
-
17 uncoordinated region
район «нарушения координации»Специфический участок Х-хромосомы Drosophila melanogaster (диск 19E8 политенного комплекса), соответствующий локусу unc - мутации в этом локусе (они полулетальны) обусловливают нарушения координации движения ног; Р."н.к." локализован на границе эу- и гетерохроматина и связан с проявлением нестабильного эффекта положения variegated position effect; он детерминирует по крайней мере 6 разных транскриптов и включает повторяющиеся последовательности, тандемно организованные вместе с экзонами.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > uncoordinated region
-
18 Transcript Request Form
Общая лексика: Форма для запроса транскриптовУниверсальный англо-русский словарь > Transcript Request Form
-
19 decapentaplegic transcript
Иммунология: декапентаплегический транскрипт (мРНК из 15 нуклеотидных пар, входящих в семейство TCF-[beta]-транскриптов)Универсальный англо-русский словарь > decapentaplegic transcript
-
20 transcription mapping
Общая лексика: транск ("Привязка" индивидуальных транскриптов (клонов кДНК или экспрессированных последовательностей -мишеней) к хромосомным районам с помощью метода флуоресцентной гибридизации in situ, ПЦР и т.д.)
- 1
- 2
См. также в других словарях:
Обратных транскриптов полимеразная цепная реакция кДНК-ПЦР РНК-ПЦР — Обратных транскриптов полимеразная цепная реакция, кДНК ПЦР, РНК ПЦР * зваротных транскрыптаў полімеразная ланцуговая рэакцыя, кДНК ПЛР, РНКПЛР * reverse transcription polymerase chain reaction or RT PCR or cDNA PCR or RNA PCR процедура… … Генетика. Энциклопедический словарь
РНК-интерференция — Доставка малых РНК, содержащих шпильки, при помощи вектора на основе лентивируса и механизм РНК интерференции в клетках млекопитающих РНК интерференция (а … Википедия
Транскриптом — Транскриптом совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие транскриптом может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор… … Википедия
Кэп — У этого термина существуют и другие значения, см. Кэп (значения). Кэп (5 кэп, кэп структура) (от англ. cap шапочка) один или несколько модифицированных нуклеотидов на 5 конце транскриптов, синтезированных РНК полимеразой II. С… … Википедия
гены синтезирующая машина — * машына, якая сінтэзуе гены * gene machine автоматический ДНК синтезатор для получения коротких (как правило, длиной в 15 30 п. о.) нитей ДНК для использования их в полимеразной цепной реакции. Гены сложные * гены складаныя * compound genes гены … Генетика. Энциклопедический словарь
Репарация р ДНК — Репарация, р. ДНК * рэпарацыя, р. ДНК * repair or reactivation or restoration or recovery or recupation or protection or DNA reparation восстановление нативной структуры ДНК, имевшей повреждения, которые возникли спонтанно в процессе репликации… … Генетика. Энциклопедический словарь
T-ДНК переносимая ДНК — T ДНК, переносимая ДНК * T ДНК, пераносная ДНК * T DNA or transferred DNA часть Ti плазмиды (см.) в вирулентной Agrobacterium tumefaciens или Ri плазмиды (см.) в вирулентной Agrobacterium rhizogenes, которая переносится из бактерии в ядерный… … Генетика. Энциклопедический словарь
рибонуклеиновые кислоты — (РНК), высокомолекулярные органические соединения, тип нуклеиновых кислот. Образованы нуклеотидами, в которые входят аденин, гуанин, цитозин и урацил и сахар рибоза (в ДНК вместо урацила тимин, вместо рибозы дезоксирибоза). В клетках всех живых … Энциклопедический словарь
Терминатор (ДНК) — У этого термина существуют и другие значения, см. Терминатор. Терминатор последовательность нуклеотидов ДНК, узнаваемая РНК полимеразой как сигнал к прекращению синтеза молекулы РНК и диссоциации транскрипционного комплекса. Часто эти… … Википедия
Нуклеопротеиды — Нуклеопротеиды комплексы нуклеиновых кислот с белками. К нуклеопротеидам относятся устойчивые комплексы нуклеиновых кислот с белками, длительное время существующие в клетке в составе органелл или структурных элементов клетки в отличие от… … Википедия
Гомеозисные гены — Гомеозисные гены детерминируют процессы роста и дифференцировки. Гомеозисные гены кодируют транскрипционные факторы, контролирующие программы формирования органов и тканей. Мутации в гомеозисных генах могут вызвать превращение одной части… … Википедия