-
1 PCR
* * *Полимеразная цепная реакция, ПЦР — процесс амплификации in vitro, при котором фрагмент ДНК длиной до 15 кб может быть амплифицирован (размножен) до 108 раз (копий). Для этого синтезируются два олигонуклеотида размером в 10-30 нуклеотидов, комплементарных последовательностям на двух концах исследуемой ДНК. Избыточное количество этих двух олигонуклеотидных праймеров (см.; амплимеров) смешивается с геномной ДНК, смесь нагревается для денатурации дуплексов ДНК. При последующем снижении температуры праймеры присоединяются к их геномным гомологам и могут с помощью ДНК-полимеразы удлиниться, т. е. на ДНК-матрице синтезируется вторая цепь. Последовательный процесс (цикл процессов) денатурации, отжига праймера и его удлинения повторяется 20-40 раз. В результате происходит экспоненциальное увеличение копий изучаемой ДНК. За 25 амплификационных циклов количество целевых последовательностей ДНК увеличивается приблизительно в 106 раз. Для синтеза новых цепей ДНК используются термостабильные ДНК-полимеразы (Therminus aquaticus или Taq-полимераза, Pfu-ДНК-полимераза, VentTM-ДНК-полимераза). В н. вр. ПЦР нашла широкое распространение в молекулярной биологии и на ее основе разработано множество методов анализа геномов. Имеет место также инвертированная полимеразная цепная реакция, т. е. модификация обычной ПЦР, позволяющая амплифицировать неизвестные последовательности ДНК, прилежащие к коровой области известной последовательности. -
2 polymerase chain reaction
Метод амплификации in vitro с помощью ДНК-полимеразы нуклеотидных последовательностей с использованием олигонуклеотидных ДНК-затравок, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК на границах амплифицируемого участка; собственно П.ц.р. представляет собой серию из 3 циклически повторяющихся реакций (20-30 циклов) - денатурация ДНК, отжиг ДНК-затравок и синтез ДНК с каждой из затравок навстречу друг другу с использованием противоположных цепей ДНК в качестве матриц, по завершении каждого цикла количество синтезированного продукта удваивается и происходит увеличение количества анализируемой ДНК в геометрической прогрессии; П.ц.р. позволяет амплифицировать любые последовательности длиной до 5-6 тыс. нуклеотидов, что делает возможным использовать ее для секвенирования, молекулярной ДНК-диагностики, картирования генов (в качестве зондов для гибридизации in situ) и др.* * *Полимеразная цепная реакция, ПЦР — процесс амплификации in vitro, при котором фрагмент ДНК длиной до 15 кб может быть амплифицирован (размножен) до 108 раз (копий). Для этого синтезируются два олигонуклеотида размером в 10-30 нуклеотидов, комплементарных последовательностям на двух концах исследуемой ДНК. Избыточное количество этих двух олигонуклеотидных праймеров (см.; амплимеров) смешивается с геномной ДНК, смесь нагревается для денатурации дуплексов ДНК. При последующем снижении температуры праймеры присоединяются к их геномным гомологам и могут с помощью ДНК-полимеразы удлиниться, т. е. на ДНК-матрице синтезируется вторая цепь. Последовательный процесс (цикл процессов) денатурации, отжига праймера и его удлинения повторяется 20-40 раз. В результате происходит экспоненциальное увеличение копий изучаемой ДНК. За 25 амплификационных циклов количество целевых последовательностей ДНК увеличивается приблизительно в 106 раз. Для синтеза новых цепей ДНК используются термостабильные ДНК-полимеразы (Therminus aquaticus или Taq-полимераза, Pfu-ДНК-полимераза, VentTM-ДНК-полимераза). В н. вр. ПЦР нашла широкое распространение в молекулярной биологии и на ее основе разработано множество методов анализа геномов. Имеет место также инвертированная полимеразная цепная реакция, т. е. модификация обычной ПЦР, позволяющая амплифицировать неизвестные последовательности ДНК, прилежащие к коровой области известной последовательности.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > polymerase chain reaction
-
3 primer RNA
Олигорибонуклеотид, синтезируемый с участием РНК-полимеразы или ДНК-праймазы DNA primase: с 5'-конца РНК-з. с участием ДНК-полимеразы III инициируется синтез новой молекулы ДНК (или фрагмента Оказаки Okazaki fragments), после чего РНК-з. отщепляется, образующаяся брешь одновременно застраивается ДНК-полимеразой I, а одноцепочечные разрывы nick репарируются ДНК-лигазой DNA ligase.* * *Праймерная РНК — короткая последовательность РНК, синтезированная праймазой с матричной нити ДНК и служащая как необходимый праймер, к которому ДНК-полимераза присоединяет дезоксирибонуклеотиды в течение репликации ДНК. Позднее праймеры ферментативно выводятся, гэпы закрываются ДНК-полимеразой I, а оставшиеся ники закупориваются лигазой.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > primer RNA
-
4 degenerate primers
Генная инженерия: "вырожденные" праймеры (Синтетические олигонуклеотиды, в одном из сайтов которых находятся разные основания) -
5 PCR in situ hybridization
ПЦР-гибридизация in situ — вариант ПЦР, т.е. полимеразной цепной реакции, когда ДНК амплифицируется и выявляется на морфологически интактных клетках или тканях. Для этого клетки или ткань фиксируются, закрепляются на предметном стекле для микроскопирования и обрабатываются протеазой. Затем добавляются все необходимые для ПЦР реагенты, стекло помещается прямо на термоблок амплификатора, добавляется Taq-полимераза и слайд покрывается минеральным маслом. Амплифицированный продукт может быть выявлен гибридизацией in situ или прямым инкорпорированием (включением) в продукт ПЦР нуклеотидов, меченных биотином или дигоксигенином (см. Дигоксигенином мечение). При этом методе в качестве праймеров используют множественные перекрывающиеся праймеры или конкатамеры.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > PCR in situ hybridization
-
6 random amplified polymorphic DNA
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > random amplified polymorphic DNA
-
7 RAPD
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК, ПАПД — фрагмент ДНК, амплифицированный методом полимеразной цепной реакции с помощью коротких олигодезоксирибонуклеотидных праймеров (см. Праймер), представляющих собой произвольно взятые (случайные) нуклеотидные последовательности (амплимеры). Метод заключается в том, что с геномной ДНК отжигаются (см. Отжиг), или гибридизуются, единичные праймеры из 10 произвольных (случайных) нуклеотидов. После обычной ПЦР амплифицированные фрагменты электрофоретически отделяются в агарозном геле и при окрашивании этидиум бромидом рассматриваются в УФ свете на трансиллюминаторе. При сравнении таких фрагментов от двух близких организмов обнаруживается полиморфизм по их длине. Выявляемые полиморфные по длине фрагменты могут использоваться как генетические маркеры для конструирования генетических карт. -
8 targeted gene walking polymerase chain reaction
Шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена — вариант обычной полимеразной цепной реакции (см.) для амплификации (см.) неизвестной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз (влево или вправо) от известной последовательности. Для этого первый последовательность-специфический ПЦР-праймер (целевой праймер, т.е. комплементарный экзону) и второй специфический праймер (внутренний праймер, гибридизующийся с той же нитью ДНК и расположенный близко к сайту целевого праймера) отжигаются (гибридизуются) к их целевым сайтам (мишеням) в геноме. Затем неспецифические, т.н. "шагающие" праймеры, комплементарные к последовательностям, расположенным выше или ниже мишени и сайта связывания внутреннего праймера, используются для амплификации расположенных между ними районов с помощью <I>Taq</I> ДНК-полимеразы (см. <I> полимераза Taq -полимераза </I>). Эту технику можно применять для изоляции последовательностей, прилежащих к уже известным районам без процедуры клонирования (см.) и выделения, а также для ДНК-фингерпринтинга (см.), обнаружения регуляторных районов и изолирования генов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > targeted gene walking polymerase chain reaction
-
9 degenerate primers
Англо-русский словарь по биотехнологиям > degenerate primers
См. также в других словарях:
Праймеры — искусственно синтезированные олигонуклеотиды, комплиментарные соответствующим участкам ДНК мишени... Источник: ПОРЯДОК И ОРГАНИЗАЦИЯ КОНТРОЛЯ ЗА ПИЩЕВОЙ ПРОДУКЦИЕЙ, ПОЛУЧЕННОЙ ИЗ/ИЛИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ И … Официальная терминология
Праймеры — Праймер (primer) это короткий фрагмент нуклеиновой кислоты, который служит стартовой точкой при репликации ДНК. Праймеры необходимы ДНК полимеразам, так как ДНК полимеразы могут только наращивать существующую цепь. Полимеразы начинают репликацию … Википедия
Праймеры — 13. Праймеры искусственно синтезируемые короткие последовательности нуклеотидов, комплементарные определенному участку искомой ДНК, используемые в полимеразной цепной реакции. Источник … Словарь-справочник терминов нормативно-технической документации
Феромоны-праймеры — Феромоны, вызывающие долговременный физиологический эффект или физиологические изменения преимущественно гормонального характера в организме реципиента, например, влияющие на эстральный цикл особей женского пола. Также называются прайминг… … Психология ощущений: глоссарий
Полимеразная цепная реакция — (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе). Помимо амплификации ДНК, ПЦР… … Википедия
ДНК-маркер — Рис.1 Электрофорез ПЦР продуктов в агарозном геле и окрашенных бромистым этидием, полученных методом IRAP амплификации. Левая дорожка ДНК известной длины (от 900 до 3000 пар нуклеотидов) … Википедия
ПЦР — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Полимеразная цепная — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
ДНК-полимераза — Трёхмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализир … Википедия
ДНК-зависимая ДНК-полимераза — Трехмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализируют полимеризацию дезоксирибонуклеотидов вдоль цепочки… … Википедия
ДНК-полимеразы — Трехмерная структура ДНК связывающих спирально шпилечных участков в человеческой бета ДНК полимеразе ДНК полимераза фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализируют полимеризацию дезоксирибонуклеотидов вдоль цепочки… … Википедия