-
21 рестриктаза
1) Biology: restriction endonuclease, restriction enzyme2) Genetics: restriction endonucleases3) Biochemistry: restrictase (фермент), restriction enzyme (фермент)4) Makarov: restriction nuclease -
22 endonuclease
Фермент, способный осуществлять гидролиз внутренних фосфодиэфирных связей и таким образом расщеплять молекулы ДНК или РНК; Э. участвуют в рекомбинации recombination, репарации repair, а Э., участвующие в рестрикции restriction, называют рестриктазами restriction endonucleases.* * *Эндонуклеаза — фермент, катализирующий разрыв внутренних фосфодиэфирных связей (гидролиз) в одно- или двунитчатой молекуле ДНК или РНК. Напр., Bal31-нуклеаза, ДНКаза, рестрикционные Э., РНКазы, S1-нуклеаза и др. участвуют в рекомбинации, репарации и рестрикции.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > endonuclease
-
23 RARE cleavage
Метод анализа последовательностей ДНК с помощью рестриктаз restriction endonucleases, включающий этап индуцированного белком RecA (кодируется геномом E.coli) присоединения олигонуклеотида к комплементарному участку двухцепочечной молекулы ДНК с образованием трехцепочечного комплекса, что защищает данный сайт от расщепления рестриктазами; после удаления RecA и олигонуклеотида рестрикция происходит исключительно в анализируемом сайте; М.RARE-р. предложен Л.Феррином и Р.Камерини-Отеро в 1991.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > RARE cleavage
-
24 ферменты
Вещества белковой природы, присутствующие во всех живых клетках, направляющие, регулирующие и многократно ускоряющие биохимические процессы в них; играют важнейшую роль в метаболизме (см. также биокатализаторы).
Механизм повышения активности ферментов непосредственным воздействием на него путём связывания молекулы активатора в аллостерическом сайте на фермент, что приводит к изменению конфигурации фермента и в результате – к изменению формы активного сайта. Фермент может быть активирован химической модификацией, в свою очередь активированной ферментом.
Способность данного ферментного препарата катализировать специфическую реакцию. Активность может быть выражена числом молей превращаемого субстрата или продукта на единицу времени и единицу массы белка (например, микромоли на милиграмм белка в минуту).
Ферменты, обнаруживающие необычные кинетические свойства в ответ на изменения в концентрации субстрата и/или в ответ на действие аллостерических эффекторов, которые не являются субстратами.
Ферменты, участвующие в анаболических реакциях обмена веществ.
гидролитические ферменты — hydrolytic enzymes, digestive enzymes, hydrolases
Ферменты, катализирующие реакцию гидролиза.
Количество фермента, которое катализирует трансформацию одного микромоля субстрата в единицу времени ( например в 1 мин) при определённой температуре, pH и концентрации субстрата.
Форма ДНК-полимеразы, способная восстанавливать последовательности оснований.
иммобилизованные ферменты — immobilized enzymes (см. также иммобилизация)
Механизм инактивации ферментов химическим агентом.
Синтез фермента в ответ на действие индуцируемого агента, который стимулирует экспрессию генов, кодирующих белок со специфичной ферментной функцией.
Ферменты, образующиеся в ответ на индуцирующий агент. Механизм индукции зависит от действия индуктора на транскрипцию и трансляцию, а не на сам фермент.
Ферменты, участвующие в катаболических реакциях обмена веществ.
Систематизация ферментов по субстрату, с которым они вступают в реакцию, и типу катализируемой ими реакции.
Ферменты, образующиеся непрерывно вне зависимости от условий среды.
Ферменты, проявляющие активность только при изменении условий.
Ферменты, катализирующие реакцию гидролиза.
Ферменты, локализация которых известна. Проба на эти ферменты может использоваться при выделении или очистке субклеточных фракций.
Методы отделения и очистки ферментов, включающие отделение твёрдых веществ, мембранную фильтрацию, абсорбционную хроматографию, гель-фильтрацию и т. д.
Ферменты, расщепляющие пектины; образуются бактериями и грибами. В промышленности для получения пектолитических ферментов используются Aspergillus niger и Sclerotinia libertiana; применяются в технических целях, например для осветления фруктовых соков (см. также пектинэстеразы).
Ферменты, присутствующие в свободной или связанной форме в периплазматическом пространстве.
Ферменты, гидролизующие белки с образованием аминокислот.
Белок, связывающийся с цепочками ДНК в растущей точке вилки репликации в процессе репликации двухцепочечной ДНК.
Фермент, сохраняющий или восстанавливающий спиральную структуру двунитевой ДНК в процессе репликации кольцеобразной молекулы ДНК.
Ферменты с регуляторной функцией в метаболизме.
Оптимизация процессов метаболизма, осуществляемая с помощью регуляции ферментов на двух уровнях:
1) экспрессии генов и синтеза белка путем индукции и репрессии;
2) на ферментном уровне путём ингибирования или активации фермента в результате связывания молекулы эффектора в аллостерическом сайте на ферменте.
Ферменты, катализирующие замещение дефектных участков цепей двойной спирали ДНК (см. также полимераза и эндонуклеазы).
Механизм, предотвращающий синтез ферментов путём образования репрессоров, которые связываются с ДНК, препятствуя транскрипции.
ферменты рестрикции — restriction enzymes, restriction endonucleases
Ферменты, катализирующие расщепление инфицирующей фаговой ДНК; благодаря своему нуклеазному действию они препятствуют проникновению чужеродной ДНК в бактериальную клетку (см. также рестриктазы и эндонуклеазы).
Способность ферментов отличать свой истинный субстрат от других родственных молекул, обусловленная высокой специфичностью фермент-субстратных взаимодействий.
Фермент, содержащийся в желудке млекопитающих; препарат химозин, получаемый из этого фермента, используется для свертывания молока в сыроварении.
Активность ферментов, выраженная как количество или число молей субстрата, превращаемого в единицу времени на единицу веса белка.
Отделение ферментов от загрязняющих материалов с целью повышения их удельной активности. Используются два способа: отделение фермента от твёрдой субстратной культуры; выделение фермента из микробных клеток. Экстрацеллюлярные ферменты отделяются простым отмыванием. Для выделения внутриклеточных ферментов клетки должны быть разрушены химическими, биохимическими или механическими методами (см. также дезинтеграция).
Русско-английский словарь терминов по микробиологии > ферменты
-
25 chi(-like) structure
Структура, образующаяся при разрезании «восьмерки» figure-eight рестриктазами restriction endonucleases: разрезанная молекула имеет 4 ответвления, соединенных в сайте обмена, причем каждая пара ответвлений соответствует каждому из исходных мономерных колец ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > chi(-like) structure
-
26 chi(-like) structure
Структура, образующаяся при разрезании «восьмерки» figure-eight рестриктазами restriction endonucleases: разрезанная молекула имеет 4 ответвления, соединенных в сайте обмена, причем каждая пара ответвлений соответствует каждому из исходных мономерных колец ДНК.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > chi(-like) structure
-
27 cohesive (sticky) ends
«липкие концы»Комплементарные друг другу, выступающие однонитевые участки одного или разных двухцепочечных фрагментов ДНК, по "Л.к." фрагменты могут соединяться друг с другом с образованием гибридных молекул ДНК; "Л.к." могут образовываться при действии на ДНК некоторых рестриктаз restriction endonucleases (например, EcoRI и BamHI).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > cohesive (sticky) ends
-
28 cohesive (sticky) ends
«липкие концы»Комплементарные друг другу, выступающие однонитевые участки одного или разных двухцепочечных фрагментов ДНК, по "Л.к." фрагменты могут соединяться друг с другом с образованием гибридных молекул ДНК; "Л.к." могут образовываться при действии на ДНК некоторых рестриктаз restriction endonucleases (например, EcoRI и BamHI).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > cohesive (sticky) ends
-
29 deoxyribonuclease
дезоксирибонуклеаза, ДНК-азаФермент, катализирующий гидролитическое расщепление полинуклеотидной цепи ДНК с образованием отдельных нуклеотидов и (или) олигонуклеотидов; Д. экзонуклеазы exonuclease, рестриктазы restriction endonucleases и др.* * *Дезоксирибонуклеаза — фермент, который расщепляет ДНК на олигонуклеотидные фрагменты (см. Эндонуклеаза. Экзонуклеаза. Рестрикционные эндонуклеазы).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > deoxyribonuclease
-
30 DNA methyltransferases
Группа ферментов, осуществляющих метилирование methylation оснований в ДНК; у прокариот известно несколько ДНК-м., специфичных в отношении «окружения» метилируемого основания, - например, продукт гена dam метилирует аденин в последовательности ГАТЦ, что позволяет ферментам репаративной системы отличать родительскую цепь ДНК от дочерних (неметилированных); модифицирующие ДНК-м. метилируют основания в сайтах рестрикции, делая их устойчивыми к действию соответствующих рестриктаз restriction endonucleases; у эукариот метилирование цитозина в положении С-5 с участием ДНК-м. является механизмом контроля активности генов (как правило, метилированные гены репрессированы, и наоборот); 2'-O-метилтрансфераза осуществляет метилирование кэпа cap.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > DNA methyltransferases
-
31 EcoRI
Одна из наиболее широко применяемых рестриктаз restriction endonucleases, выделяемая из E.coli (к 1991 выделено 7 рестриктаз группы EcoR - от EcoRI до EcoRVII); расщепляет ДНК с образованием «липких концов» cohesive ends.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > EcoRI
-
32 hemimethylated DNA
Участок молекулы ДНК, на котором метилирована только одна из двух цепей:такой сегмент может быть метилирован и по второй цепи с участием фермента метилазы и, как правило, является устойчивым к расщеплению рестриктазами restriction endonucleases; часто П.ДНК образуется в результате репликации полностью метилированной ДНК fully methylated DNA.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > hemimethylated DNA
-
33 inverse PCR
Модификация метода полимеразной цепной реакции polymerase chain reaction, при которой амплифицируемый участок ДНК получают с помощью рестриктаз restriction endonucleases с последующим замыканием фрагмента в кольцо; О.п.ц.р. позволяет амплифицировать участки ДНК с неизвестной первичной структурой, фланкирующие небольшой участок, последовательность нуклеотидов которого известна и к которому синтезируются олигонуклеотидные затравки.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > inverse PCR
-
34 isoschizomeres
Рестриктазы restriction endonucleases разного происхождения, узнающие одну и ту же последовательность ДНК, но при этом часто по-разному реагирующие на уровень метилирования methylation отдельных оснований в ней, - например, ферменты MboI, DpnII, PfaI и др. узнают тетрануклеотид ГАТЦ, т.е. являются И.* * *Изошизомеры — рестрикционные эндонуклеазы (см., рестриктазы), происходящие (получаемые) из различных бактерий, но связывающиеся с одним сайтом узнавания и разрезающие одну и ту же последовательность ДНК, при этом часто поразному реагирующие на уровень метилирования в ней отдельных оснований (напр., ферменты MbolI, DonII, PfaI и др. узнают тетрануклеотид GATC, т. е. являются И.). Эндонуклеазы HpaII и Msp1, напр., разрезают ДНК в сайте 51 ….. C I C GG …..31. 31 ….. GGC I C …..5'И. являются также Sau 3AI и Bam HI и многие др. рестриктазы.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > isoschizomeres
-
35 linearization
Преобразование кольцевой молекулы ДНК в линейную после единичного двухцепочечного разрыва - например, в результате гидролиза плазмидной ДНК plasmid рестриктазами restriction endonucleases.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > linearization
-
36 mitochondrial genome
Кольцевая двунитевая молекула ДНК, входящая в состав митохондрий mitochondrion( размер мтДНК у животных обычно около 16 тыс. пар оснований, а в различных группах растений и микроорганизмов эта величина существенно больше и высокоизменчива); М.г. включает гены тРНК и рРНК, некоторых ферментов (субъединицы АТФазы, цитохромоксидазы cytochrome oxidase и др.), в нем имеются некоторые отклонения от универсального триплетного кода (например, триплет УГА, являющийся стоп-кодоном в ядерном геноме, в М.г. животных кодирует триптофан); как правило, М.г. наследуется по материнскому типу maternal inheritance; анализ структуры мтДНК с использованием рестриктаз restriction endonucleases широко применяется в популяционно-генетических исследованиях.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > mitochondrial genome
-
37 modification
Процесс пострепликативного (постсинтетического) изменения структуры ДНК; наиболее распространенная М. - метилирование methylation, служащее, в частности, для защиты от собственных рестриктаз restriction endonucleases и регуляции активности генов, к М. относятся дезаминирование, фосфорилирование и др.; также М. - изменение фенотипического признака под действием фактора внешней среды без изменений генотипа (т.е. изменение в пределах генетически обусловленной нормы реакции организма).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > modification
-
38 modification methylases
Бактериальные ферменты, контролирующие процесс метилирования methylation определенных оснований в сайтах рестрикции, что обеспечивает защиту ДНК от расщепления собственными рестриктазами restriction endonucleases.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > modification methylases
-
39 nuclease
Фермент, катализирующий реакцию гидролиза фосфодиэфирных связей полипептидных цепей с образованием моно- и олигонуклеотидов; по специфичности действия различают экзонуклеазы exonuclease и эндонуклеазы endonuclease, рибонуклеазы и дезоксирибонуклеазы, рестриктазы restriction endonucleases и т.д.* * *Нуклеаза — фермент, расщепляющий нуклеиновые кислоты и продукты их распада. Катализирует гидролиз фосфодиэфирных связей в молекулах нуклеиновых кислот, что ведет к разрыву этих связей и образованию моно- и олигонуклеотидов. Н. подразделяются на экзонуклеазы, отделяющие нуклеотиды с концов молекул нуклеиновых кислот, и эндонуклеазы, расщепляющие нуклеиновые кислоты во внутренних сайтах. Существуют Н., специфичные для ДНК (дезоксирибонуклеазы, ДНКазы) или РНК (рибонуклеазы, РНКазы) и для однонитчатых или двунитчатых полинуклеотидов ( рестриктазы, см.). В процессе выделения нуклеиновых кислот из клеток растений и животных Н. могут разрушать их, поэтому в экстракционный буфер добавляются различные вещества (напр., EDTA), ингибирующие Н.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > nuclease
-
40 palindrome
Участок двухцепочечной молекулы ДНК, обе цепи которого обладают одинаковой последовательностью нуклеотидов при прочитывании от 5'- к 3'-концу, т.е. П. является тандемным инвертированным повтором, например:5' ААТГЦГЦАТТ 3'3' ТТАЦГЦГТАА 5'П. играют важную роль в обеспечении процессов терминации транскрипции (у прокариот П. обнаружены во всех терминаторных участках генов), являются сайтами действия рестриктаз restriction endonucleases, а также участвуют в ряде др. процессов.* * *Палиндром — последовательности в двунитчатой ДНК, в которой одинаковые основания расположены в противоположных направлениях: П. является сайтом-мишенью ( сайтом узнавания, см.) для различных ДНК-связывающих белков, напр. рестрикционные эндонуклеазы (см. Эндонуклеаза), РНК-полимеразы, факторы транскрипции (см. Транскрипционные факторы), и встречаются во многих промоторах, ориджинах репликации (см. Репликации ориджин) и в последовательностях, терминирующих (прекращающих) транскрипцию (см. Крестообразная структура).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > palindrome
См. также в других словарях:
restriction endonucleases — (= restriction enzymes) Class of bacterial enzymes that cut DNA at specific sites. In bacteria their function is to destroy foreign DNA, such as that of bacteriophages (host DNA is specifically modified at these sites). Type I restriction… … Dictionary of molecular biology
restriction endonucleases — restriction endonucleases. См. рестрикционная эндонуклеаза. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
Restriction enzyme — Glossary Restriction … Wikipedia
Restriction fragment — A restriction fragment is a DNA fragment resulting from cutting of a DNA strand by a restriction enzyme (restriction endonucleases), a process called restriction. Each restriction enzyme is highly specific, recognising a particular short DNA… … Wikipedia
Restriction map — A restriction map is a map of known restriction sites within a sequence of DNA. Restriction mapping requires the use of restriction enzymes. In molecular biology, restriction maps mdash;along with DNA DNA hybridization, and DNA or RNA sequence… … Wikipedia
Restriction digest — A restriction digest is a procedure used in molecular biology to prepare DNA for analysis or other processing. It is sometimes termed DNA fragmentation (this term is used for other procedures as well). Hartl and Jones describe it this way: This… … Wikipedia
Restriction endonuclease — An enzyme from bacteria that can recognize specific base sequences in DNA and cut (restrict) the DNA at that site (the restriction site). Also called a restriction enzyme. * * * restriction endonuclease n RESTRICTION ENZYME * * * see restriction… … Medical dictionary
restriction fragment length polymorphism — Abbreviation: RFLP A class of genetic marker based on the detection of variation in the length of restriction fragments generated when DNA is treated with restriction endonucleases. Differences in fragment lengths arise due to genetic variation… … Glossary of Biotechnology
restriction map — Map of DNA showing the position of sites recognized and cut by various restriction endonucleases … Dictionary of molecular biology
restriction fragment — A shortened DNA molecule generated by the cleavage of a larger molecule by one or more restriction endonucleases … Glossary of Biotechnology
Restriction modification system — The restriction modification system (RM system) is used by bacteria, and perhaps other prokaryotic organisms to protect themselves from foreign DNA, such as bacteriophages. This phenomenon was first noticed in the 1950s. Certain bacteria strains… … Wikipedia