-
1 RNA sequencing
Biotechnology: RNA-seq -
2 РНК
Одна из нуклеиновых кислот; биополимер, состоящий из нуклеотидов, содержащих рибозу; РНК находится преимущественно в рибосомах, в меньшем количестве присутствует в ядре и митохондриях; играет важную роль в биосинтезе белка в клетке.
Присоединение аминокислоты к 3'-концевому аденозину молекулы тРНК с образованием аминоацил-тРНК; катализируется ферментом аминоацил-тРНК-синтетазой.
гетерогенная ядерная РНК — heterogeneous nuclear RNA, hnRNA
РНК с большой молекулярной массой, продукт первичной транскрипции эукариотных структурных генов. Содержит последовательности экзонов и интронов, превращается в иРНК при элиминации интронов.
Осуществляется путём щелочного гидролиза.
Фермент, катализирующий синтез РНК.
информационная РНК — messenger RNA, mRNA
Форма РНК, осуществляющая передачу записанной в ДНК информации к местам синтеза белка, состоит из одной цепи и содержит от одной до десяти тысяч пар оснований.
матричная РНК — messenger RNA, mRNA
РНК-полимераза — RNA polymerase (см. также полимераза)
Образование рРНК при расщеплении спейсерных (см. также спейсер) последовательностей.
Образование функционально активных молекул из более длинного предшественника, который подвергается расщеплению и модификации с включением минорных оснований.
РНК, растворимая при низких значениях рН; к растворимым РНК относятся матричная и транспортная РНК.
Копирование генетической информации, содержащейся в РНК вирусного генома; катализируется РНК-репликазами. Образующиеся молекулы РНК служат далее матрицами для синтеза РНК молекул потомков.
рибосомная РНК — ribosomal RNA, rRNA
РНК, нековалентно связанная с рибосомными белками в обеих рибосомных субъединицах и составляющая около 80% общей клеточной РНК.
Синтез молекул РНК, включает стадии инициации, элонгации и терминации.
Образование молекул рРНК, обусловленное посттранскрипционным процессингом предшественников (см. также процессинг).
Удаление последовательностей РНК, соответствующих интронам ДНК, и соединение участков, которые транскрибированы с кодирующих последовательностей ( экзонов).
РНК-транскриптаза — RNA transcriptase (см. также транскриптазы)
транспортная РНК — transfer RNA, tRNA
Низкомолекулярная молекула РНК ( содержит 75-90 нуклеотидов), связывающая аминокислоту и переносящая её к рибосомам для включения в полипептидную цепочку при трансляции.
Стадия транскрипции, которая наступает после присоединения около восьми рибонуклеотидов.
-
3 секвенирование
Определение последовательности аминокислотных остатков в белках и последовательности нуклеотидов в нуклеиновых кислотах.
секвенирование белка — protein sequencing (см. также белки)
секвенирование ДНК — DNA sequencing (см. также ДНК)
Метод определения нуклеотидной последовательности, основанный на синтезе радиоактивно меченой комплементарной цепи ДНК с использованием в качестве матрицы нативной ДНК. В реакционной смеси присутствуют четыре немеченых дезоксирибонуклеозидфосфата, из которых строится комплементарная цепь ДНК, и модифицированная форма одного из оснований, при включении которого рост цепи прекращается. В результате синтезируются цепочки ДНК различной длины. Цепи разделяют с помощью гель-электрофореза и проводят радиоавтографию. Последовательность оснований считывают непосредственно с фотоплёнки.
секвенирование ДНК методом химического расщепления по Максаму и Гилберту — Maxam-Gilbert chemical sequencing cleavage
Метод определения нуклеотидной последовательности, при котором метят 3'-конец молекулы ДНК радиоактивным фосфатом (32PO43–). Затем ДНК обрабатывают реагентами, расщепляющими эту цепь около определённых оснований. С помощью электрофореза в полиакриламидном геле разделяют фрагменты разной длины. Последовательность оснований считывают с плёнки, полученной методом радиоавтографии.
секвенирование РНК — RNA sequencing (см. также РНК)
Метод определения последовательности оснований в самой РНК, для чего сначала метят 5'- конец или 3'-конец молекулы РНК с помощью 32PO43–. Затем меченую цепь расщепляют с помощью ферментов, специфичных к определённым последовательностям. Используя радиографию, получают карту, по которой находят последовательность оснований.
Метод определения последовательности оснований, в котором вначале синтезируют цепочку ДНК, комплементарную РНК, а затем определяют её нуклеотидную последовательность. Далее с помощью метода химического расщепления для секвенирования ДНК получают радиоавтограмму.
Русско-английский словарь терминов по микробиологии > секвенирование
-
4 ДНК
DNA – сокр. от deoxyribonucleic acidБиополимер (сокр. от дезоксирибонуклеиновая кислота), материальная форма хранения наследственной информации.
Пул генетически компетентной ДНК фага, образующийся во время вегетативного состояния фага, но ещё не собранный в законченные частицы фага.
двойная спираль ДНК — DNA double helix, double-helical structure of DNA, double-stranded DNA
Модель структуры ДНК, построенная Уотсоном и Криком, согласно которой молекула ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей, образующих правую спираль относительно одной и той же оси. Направление цепей взаимно противоположное.
Расхождение двух полинуклеотидных цепей ДНК в результате разрыва водородных связей при нагревании или под действием, например, щёлочи.
дуплексная ДНК — DNA duplex, double-stranded DNA
Двухцепочечная молекула ДНК. Синоним двойной спирали ДНК.
комплементарная ДНК — complementary DNA, cDNA
Цепочка ДНК, содержащая последовательности оснований, комплементарные противоположной цепочке.
ДНК участков, соединяющих одну нуклеосому с другой.
Метилирование или глюкозилирование определённых оснований ДНК, обычно аденина или цитозина; процесс необходим клетке для защиты собственной ДНК от воздействия рестрикционной эндонуклеазы.
молчащая ДНК — silent DNA (см. также интроны)
моноцистронная ДНК — monocistronic DNA (см. также моноцистронный)
Двухцепочечная ДНК из клетки с интактными водородными связями между цепочками.
Одна цепочка ДНК, содержащая перевёрнутую последовательность оснований, которая может складываться в обратную сторону и таким образом гибридизоваться сама с собой.
Последовательности чужеродной ДНК, встроенные в клонирующий вектор.
Период синтеза ДНК в интерфазе.
Способность двойной спирали ДНК принимать различные конформации.
ДНК, образованная в результате объединения фрагментов ДНК разного происхождения. На рекомбинантной ДНК основан метод генетической инженерии in vitro.
Процесс, при котором информация, закодированная в последовательности оснований молекулы родительской ДНК, передаётся с максимальной точностью дочерней ДНК за счёт комплементарности пар оснований AT и GC (см. также репликация).
рибосомная ДНК — ribosomal DNA, rDNA
ДНК, кодирующая рибосомную РНК.
сателлитная ДНК — satellitie DNA, highly-repetitive DNA
ДНК, состоящая из обладающих характерными особенностями нуклеотидных последовательностей ( их длина может составлять от 10 до 200 нуклеотидов), которые расположены тандемно и сотни раз повторяются. Функция этой ДНК пока не выяснена.
Кольцевая замкнутая ДНК, в которой число витков двойной спирали превышает величину, характеризующую линейную ДНК, находящуюся в тех же условиях. Сверхспирализация – важнейшее свойство ДНК, влияющее на её функционирование в клетке.
ДНК, располагающаяся между генами; транскрибируется не всегда.
Репаративный синтез в отличие от репликативного.
ДНК неизвестной функции.
ДНК с повторяющимися последовательностями — repetitious DNA, repetitive DNA
ДНК, в которой последовательности оснований повторяются многократно в геноме клетки.
Тип упаковки генетического материала в клетках высших организмов.
химерная ДНК — chimeric DNA, hybrid DNA
Гибридная ДНК, полученная путём вставки фрагмента чужеродной ДНК в плазмиду.
ДНК, не содержащаяся в нормальном комплекте хромосомы данного организма. Встраивание такой ДНК может иметь место, например, при вирусной инфекции.
См. также в других словарях:
Sequencing — For the sense of sequencing used in electronic music, see the music sequencer article. For sequence learning in cognitive science, see sequence learning. In genetics and biochemistry, sequencing means to determine the primary structure (sometimes … Wikipedia
RNA-Interferenz — Übergeordnet Gen Silencing Post Transkriptionelles Gen Silencing Gene Ontology … Deutsch Wikipedia
Sequencing — Learning the order of nucleotides (base sequences) in a DNA or RNA molecule or the order of amino acids in a protein. In the case of DNA sequencing, the precise ordering of the bases (A,T,G,C) from which the DNA is composed is determined. * * *… … Medical dictionary
DNA sequencing — Part of a series on Genetics Key components Chromosome DNA • RNA Genome Heredity Mutation Nucleotide Variation … Wikipedia
Degradome sequencing — (Degradome Seq),[1][2] also referred to as parallel analysis of RNA ends (PARE),[1][2] is a modified 5 rapid amplification of cDNA ends (RACE) with high throughput deep sequencing (SBS) method. Degradome sequencing provides a comprehensive means… … Wikipedia
Bisulfite sequencing — Figure 1: Outline of bisulfite conversion of sample sequence of genomic DNA. Nucleotides in blue are unmethylated cytosines converted to uracils by bisulfite, while red nucleotides are 5 methylcytosines resistant to conversion … Wikipedia
Chip-Sequencing — ChIP Sequencing, also known as ChIP Seq, is used to analyze protein interactions with DNA. ChIP Seq combines chromatin immunoprecipitation (ChIP) with massively parallel DNA sequencing to identify the cistrome of DNA associated proteins. It can… … Wikipedia
Long non-coding RNA — Long noncoding RNAs (long ncRNAs) are generally considered (somewhat arbitrarily) as non protein coding transcripts longer than 200 nucleotides. This limit is due to practical considerations including the separation of RNAs in common experimental … Wikipedia
Protein sequencing — Proteins are found in every cell and are essential to every biological process, protein structure is very complex: determining a protein s structure involves first protein sequencing determining the amino acid sequences of its constituent… … Wikipedia
SraH RNA — SraH (also known as RyhA) is a is a small non coding RNA (ncRNA). It is the functional product of a gene which is not translated into protein.This non coding RNA was discovered in the bacteria Escherichia coli during a large scale computational… … Wikipedia
Full genome sequencing — Genome sequencing redirects here. For the sequencing only of DNA, see DNA sequencing. An image of the 46 chromosomes, making up the diploid genome of human male. (The mitochondrial chromosome is not shown.) Full genome sequencing (FGS), also… … Wikipedia
