-
1 секвенирование
Определение последовательности аминокислотных остатков в белках и последовательности нуклеотидов в нуклеиновых кислотах.
секвенирование белка — protein sequencing (см. также белки)
секвенирование ДНК — DNA sequencing (см. также ДНК)
Метод определения нуклеотидной последовательности, основанный на синтезе радиоактивно меченой комплементарной цепи ДНК с использованием в качестве матрицы нативной ДНК. В реакционной смеси присутствуют четыре немеченых дезоксирибонуклеозидфосфата, из которых строится комплементарная цепь ДНК, и модифицированная форма одного из оснований, при включении которого рост цепи прекращается. В результате синтезируются цепочки ДНК различной длины. Цепи разделяют с помощью гель-электрофореза и проводят радиоавтографию. Последовательность оснований считывают непосредственно с фотоплёнки.
секвенирование ДНК методом химического расщепления по Максаму и Гилберту — Maxam-Gilbert chemical sequencing cleavage
Метод определения нуклеотидной последовательности, при котором метят 3'-конец молекулы ДНК радиоактивным фосфатом (32PO43–). Затем ДНК обрабатывают реагентами, расщепляющими эту цепь около определённых оснований. С помощью электрофореза в полиакриламидном геле разделяют фрагменты разной длины. Последовательность оснований считывают с плёнки, полученной методом радиоавтографии.
секвенирование РНК — RNA sequencing (см. также РНК)
Метод определения последовательности оснований в самой РНК, для чего сначала метят 5'- конец или 3'-конец молекулы РНК с помощью 32PO43–. Затем меченую цепь расщепляют с помощью ферментов, специфичных к определённым последовательностям. Используя радиографию, получают карту, по которой находят последовательность оснований.
Метод определения последовательности оснований, в котором вначале синтезируют цепочку ДНК, комплементарную РНК, а затем определяют её нуклеотидную последовательность. Далее с помощью метода химического расщепления для секвенирования ДНК получают радиоавтограмму.
Русско-английский словарь терминов по микробиологии > секвенирование
-
2 РНК
Одна из нуклеиновых кислот; биополимер, состоящий из нуклеотидов, содержащих рибозу; РНК находится преимущественно в рибосомах, в меньшем количестве присутствует в ядре и митохондриях; играет важную роль в биосинтезе белка в клетке.
Присоединение аминокислоты к 3'-концевому аденозину молекулы тРНК с образованием аминоацил-тРНК; катализируется ферментом аминоацил-тРНК-синтетазой.
гетерогенная ядерная РНК — heterogeneous nuclear RNA, hnRNA
РНК с большой молекулярной массой, продукт первичной транскрипции эукариотных структурных генов. Содержит последовательности экзонов и интронов, превращается в иРНК при элиминации интронов.
Осуществляется путём щелочного гидролиза.
Фермент, катализирующий синтез РНК.
информационная РНК — messenger RNA, mRNA
Форма РНК, осуществляющая передачу записанной в ДНК информации к местам синтеза белка, состоит из одной цепи и содержит от одной до десяти тысяч пар оснований.
матричная РНК — messenger RNA, mRNA
РНК-полимераза — RNA polymerase (см. также полимераза)
Образование рРНК при расщеплении спейсерных (см. также спейсер) последовательностей.
Образование функционально активных молекул из более длинного предшественника, который подвергается расщеплению и модификации с включением минорных оснований.
РНК, растворимая при низких значениях рН; к растворимым РНК относятся матричная и транспортная РНК.
Копирование генетической информации, содержащейся в РНК вирусного генома; катализируется РНК-репликазами. Образующиеся молекулы РНК служат далее матрицами для синтеза РНК молекул потомков.
рибосомная РНК — ribosomal RNA, rRNA
РНК, нековалентно связанная с рибосомными белками в обеих рибосомных субъединицах и составляющая около 80% общей клеточной РНК.
Синтез молекул РНК, включает стадии инициации, элонгации и терминации.
Образование молекул рРНК, обусловленное посттранскрипционным процессингом предшественников (см. также процессинг).
Удаление последовательностей РНК, соответствующих интронам ДНК, и соединение участков, которые транскрибированы с кодирующих последовательностей ( экзонов).
РНК-транскриптаза — RNA transcriptase (см. также транскриптазы)
транспортная РНК — transfer RNA, tRNA
Низкомолекулярная молекула РНК ( содержит 75-90 нуклеотидов), связывающая аминокислоту и переносящая её к рибосомам для включения в полипептидную цепочку при трансляции.
Стадия транскрипции, которая наступает после присоединения около восьми рибонуклеотидов.
-
3 массивно-параллельное опознавательное секвенирование
массивно-параллельное опознавательное секвенирование
Форма анализа генной экспрессии, позволяющая дать полный профиль молекул клеточной РНК размером 21-24 рибонуклеотидов
[ http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech_Eng-Rus.pdf]Тематики
EN
Русско-английский словарь нормативно-технической терминологии > массивно-параллельное опознавательное секвенирование
-
4 массивно-параллельное опознавательное секвенирование
Biotechnology: massively parallel signature sequencing (форма анализа генной экспрессии, позволяющая дать полный профиль молекул клеточной РНК размером 21-24 рибонуклеотидов)Универсальный русско-английский словарь > массивно-параллельное опознавательное секвенирование
-
5 ДНК
DNA – сокр. от deoxyribonucleic acidБиополимер (сокр. от дезоксирибонуклеиновая кислота), материальная форма хранения наследственной информации.
Пул генетически компетентной ДНК фага, образующийся во время вегетативного состояния фага, но ещё не собранный в законченные частицы фага.
двойная спираль ДНК — DNA double helix, double-helical structure of DNA, double-stranded DNA
Модель структуры ДНК, построенная Уотсоном и Криком, согласно которой молекула ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей, образующих правую спираль относительно одной и той же оси. Направление цепей взаимно противоположное.
Расхождение двух полинуклеотидных цепей ДНК в результате разрыва водородных связей при нагревании или под действием, например, щёлочи.
дуплексная ДНК — DNA duplex, double-stranded DNA
Двухцепочечная молекула ДНК. Синоним двойной спирали ДНК.
комплементарная ДНК — complementary DNA, cDNA
Цепочка ДНК, содержащая последовательности оснований, комплементарные противоположной цепочке.
ДНК участков, соединяющих одну нуклеосому с другой.
Метилирование или глюкозилирование определённых оснований ДНК, обычно аденина или цитозина; процесс необходим клетке для защиты собственной ДНК от воздействия рестрикционной эндонуклеазы.
молчащая ДНК — silent DNA (см. также интроны)
моноцистронная ДНК — monocistronic DNA (см. также моноцистронный)
Двухцепочечная ДНК из клетки с интактными водородными связями между цепочками.
Одна цепочка ДНК, содержащая перевёрнутую последовательность оснований, которая может складываться в обратную сторону и таким образом гибридизоваться сама с собой.
Последовательности чужеродной ДНК, встроенные в клонирующий вектор.
Период синтеза ДНК в интерфазе.
Способность двойной спирали ДНК принимать различные конформации.
ДНК, образованная в результате объединения фрагментов ДНК разного происхождения. На рекомбинантной ДНК основан метод генетической инженерии in vitro.
Процесс, при котором информация, закодированная в последовательности оснований молекулы родительской ДНК, передаётся с максимальной точностью дочерней ДНК за счёт комплементарности пар оснований AT и GC (см. также репликация).
рибосомная ДНК — ribosomal DNA, rDNA
ДНК, кодирующая рибосомную РНК.
сателлитная ДНК — satellitie DNA, highly-repetitive DNA
ДНК, состоящая из обладающих характерными особенностями нуклеотидных последовательностей ( их длина может составлять от 10 до 200 нуклеотидов), которые расположены тандемно и сотни раз повторяются. Функция этой ДНК пока не выяснена.
Кольцевая замкнутая ДНК, в которой число витков двойной спирали превышает величину, характеризующую линейную ДНК, находящуюся в тех же условиях. Сверхспирализация – важнейшее свойство ДНК, влияющее на её функционирование в клетке.
ДНК, располагающаяся между генами; транскрибируется не всегда.
Репаративный синтез в отличие от репликативного.
ДНК неизвестной функции.
ДНК с повторяющимися последовательностями — repetitious DNA, repetitive DNA
ДНК, в которой последовательности оснований повторяются многократно в геноме клетки.
Тип упаковки генетического материала в клетках высших организмов.
химерная ДНК — chimeric DNA, hybrid DNA
Гибридная ДНК, полученная путём вставки фрагмента чужеродной ДНК в плазмиду.
ДНК, не содержащаяся в нормальном комплекте хромосомы данного организма. Встраивание такой ДНК может иметь место, например, при вирусной инфекции.
-
6 белки
proteins; albuminsСложные органические вещества ( полипептиды), состоящие из аминокислот, соединённых пептидными ( амидными) связями; важнейшие компоненты живой клетки (см. также альбумины).
Продукт Staphylococcus aureus, способный связывать иммуноглобулин G; используется для измерения клеточных антигенов и антител. Образует комплексы с антителами, не нарушая их связывания с антигеном. В иммобилизованной форме используется в аффинной хроматографии для разделения подклассов иммуноглобулинов, а также в различных типах иммунопроб.
Ферменты, имеющиеся во всех путях биосинтеза и ряде путей катаболизма. Кроме катаболитических центров, распознающих и связывающих субстраты, у аллостерических белков есть и другие стереоспецифические участки – аллостерические центры, а именно места связывания эффекторов, изменяющих сродство фермента к субстрату. Аллостерические эффекторы представляют собой низкомолекулярные соединения, конечные продукты биосинтеза или такие вещества, как АТФ, АДФ, АМФ, ацетил-КоА, фосфоенолпируват и NADH.
Образование белков из аминокислот; осуществляется путём последовательной поликонденсации отдельных аминокислотных остатков, начиная с амино-N-конца полипептидной цени в направлении к карбоксильному C-концу.
Общий термин для белков вирусной частицы и белков, индуцированных вирусом.
Полипептиды, образуемые экспрессией гибридного гена.
Белки, характеризующиеся более сложным способом свёртывания цепи по сравнению с фибриллярными. Эти белки сохраняют свою структуру преимущественно за счёт взаимодействия гидрофобных остатков. Примеры: миоглобин, лизоцим, карбоксипептидаза A.
Белки, потерявшие свою естественную конфигурацию при воздействии дестабилизирующего агента, например тепла (см. также денатурация).
белки, дестабилизирующие спираль — helix-destabilizing proteins, HDP
Специфичные белки, связывающиеся с разделяющимися нитями двойной спирали ДНК в вилке репликации для поддержания ДНК в «расплетённом» состоянии.
Входят в состав электрон-транспортных цепей ( участвуют в переносе протонов и электронов). Они содержат негеминовое железо, с одной стороны, связанное с атомами серы остатков цистеина, а с другой – с неорганической сульфидной серой. Помимо транспорта электронов в мембранах, эти белки участвуют в фиксации молекулярного азота, в восстановлении сульфита и нитрита, в фотосинтезе, в освобождении и активации молекулярного водорода и в окислении алканов. Железосерные белки имеют небольшую молекулярную массу ( порядка 10 кДа) и сильно отрицательный окислительно-восстановительный потенциал (см. также ферредоксины).
Различают два типа железосодержащих белков: гемопротеины и белки с негемовым железом. Первый негемовый железосодержащий белок – ферредоксин был выделен из клостридий. В настоящее время известно большое семейство белков с негемовым железом.
Встроенные в мембрану внутренние белки; амфипатические молекулы, имеют центральное гидрофобное ядро, взаимодействующее с жирнокислотными цепями и гидрофильные концы, контактирующие с клеточным содержимым и с окружением. Часто эти белки имеют углеводные цепи, присоединённые к той части молекулы, которая выступает во внеклеточную среду.
Белки, которые встроены в клеточную мембрану или мембрану клеточной органеллы или ассоциированы с ней. Молекулярная масса мембранных белков обычно варьирует в пределах от 10 кДа до 240 кДа.
Белок в своем естественном, in vivo состоянии, в противоположность денатурированному.
Структурный белок, из которого состоит оболочка вируса ( фага) и клеток микроорганизмов.
белки одноклеточных — single cell protein, SCP
Продукт выращивания дрожжей, бактерий, грибов или водорослей ради их белкового содержимого; используется в продуктах питания и животном корме, поскольку содержит углеводы, жиры, витамины и минеральные вещества.
Мембранные белки, но в отличие от интегральных ( внутренних) белков они не пронизывают мембрану и связаны с ней менее прочно.
Расщепление сигнальной последовательности, регулирующей прохождение белка через мембрану клетки или органеллы.
Белки, состоящие только из аминокислот.
Белки, осуществляющие гидролиз других белков. Продукты жизнедеятельности бактерий (например, Bacillus subtilis) и грибов. Используются в качестве добавки к моющим средствам, в кожевенной промышленности при дублении кожи, в научно-исследовательской практике.
Белки-посредники, обеспечивающие для эффекторов взаимодействие с ДНК (см. также репрессор и апорепрессор).
Процесс, обратный денатурации, при котором белки возвращают свою нативную ( биологически активную) пространственную структуру (см. также ренатурация).
Белки, входящие в состав рибосомы. Рибосомные белки характеризуются глобулярной компактной конформацией с развитой вторичной и третичной структурой; они занимают преимущественно периферическое положение в ядре, состоящем из рибосомной РНК (см. также рибосомный).
Растворимые белки, которые специфически и обратимо связывают различные вещества, включая сахара, аминокислоты, неорганические ионы и витамины.
Аналитический метод, используемый для определения последовательности аминокислот, составляющих пептид или белок (см. также секвенирование).
Химический метод синтеза пептидных связей (предложен в 1960 г. Мерифильдом, США). Этот метод получил название твёрдофазного синтеза пептидов. Метод Мерифильда прост в техническом оформлении, что позволяет полностью автоматизировать процесс.
сложные белки — conjugated proteins, proteids
Белки, содержащие помимо аминокислот небелковые компоненты, а именно ионы металла или органические молекулы – липиды, углеводы или нуклеиновые кислоты.
Белки, функционирующие как структурные компоненты клетки.
Гистоны - структурные белки эукариотических хромосом; относительно небольшие белки с очень большой долей положительно заряженных аминокислот ( лизина и аргинина); положительный заряд помогает гистонам прочно связываться с ДНК ( которая заряжена сильно отрицательно) независимо от её нуклеотидной последовательности (см. также хромосомный).
См. также в других словарях:
Секвенирование — биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от лат. sequentum последовательность). В результате секвенирования получают формальное описание… … Википедия
Секвенирование ДНК — Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их первичной аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от англ. sequence последовательность). В результате получается линейное символьное описание,… … Википедия
Секвенирование прямым подходом — * секвеніраванне прамым падыходам * sequencing by direct approach метод определения последовательности оснований в самой РНК, для чего сначала метят 51или 31 конец молекулы РНК с помощью 32РО4. Затем меченую цепь расщепляют с помощью ферментов,… … Генетика. Энциклопедический словарь
Секвенирование анализ последовательности оснований — Секвенирование, анализ последовательности оснований * секвеніраванне, аналіз паслядоўнасці асноў * sequencing or sequence analysis определение последовательности оснований в ДНК или РНК или аминокислот в белке. С. включает также изучение… … Генетика. Энциклопедический словарь
Секвенирование методом копирования — * секвеніраванне метадам капіравання * sequencing by copying technique метод определения последовательности оснований, при котором вначале синтезируют цепочку ДНК, комплементарную РНК, а затем определяют ее нуклеотидную последовательность. Далее… … Генетика. Энциклопедический словарь
Секвенирование по Сэнгеру — Метод Сэнгера метод секвенирования (определения первичной последовательности нуклеотидов молекулы нуклеиновых кислот) ДНК и РНК. Метод Сэнгера также известен как метод обрыва цепи. Метод основан на присоединении к однонитчатой секвенируемой… … Википедия
массивно-параллельное опознавательное секвенирование — Форма анализа генной экспрессии, позволяющая дать полный профиль молекул клеточной РНК размером 21 24 рибонуклеотидов [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN massively parallel signature sequencing … Справочник технического переводчика
Секвинирование — Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их первичной аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от англ. sequence последовательность). В результате получается линейное символьное описание,… … Википедия
НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ — (полинуклеотиды), биополимеры, осуществляющие хранение и передачу генетич. инфор мации во всех живых организмах, а также участвующие в биосинтезе белков. Первичная структура Н. к. представляет собой последовательность остатков нуклеотидов.… … Химическая энциклопедия
ПЦР — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Полимеразная цепная — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
