Перевод: с английского на все языки

со всех языков на английский

(генов)

  • 21 chromobox

    Консервативный нуклеотидный мотив, входящий в состав некоторых генов, способных репрессировать гомеозисные гены homeotic mutations и нестабильный тип эффекта положения variegated position effect; известен в составе генов гетерохроматинового белка HP1и Polycomb дрозофил, а также в составе различных генов у др. организмов, в частности, у мыши и человека.
    * * *
    Хромобокс — консервативный нуклеотидный мотив, входящий в состав некоторых генов, способных репрессировать (см. Репрессия) гомеозисные гены и нестабильный тип эффекта положения. Х. известен в составе генов гетерохроматинового белка HP1 и Polycomb дрозофил, а также в составе различных генов у др. организмов, в частности у мыши и человека.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > chromobox

  • 22 gene flow

    Перемещение генов между популяциями, происходящий в результате межпопуляционной гибридизации; величина П.г. изменяет частоту аллелей в популяции и является фактором эволюции.
    * * *
    Генов поток — обмен генами между разными популяциями одного и того же вида за счет мигрантов, что приводит к временному изменению частоты генов многих локусов в общем пуле генов (см. Генный пул) популяции-реципиента (см. Миграция генов).

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > gene flow

  • 23 gene interaction

    Любое взаимодействие неаллельных генов в пределах генома (генотипа), отражающееся на фенотипе и, в частности, ведущее к наследованию признаков с нарушением законов Менделя; различают ряд форм В.г. комплементарность, эпистаз epistasis, межгенная супрессия intergene suppression, действие генов-модификаторов и т.п.; полный комплекс В.г. определяет баланс генов genic balance; явление В.г. открыто У.Бэтсоном в начале 1900-х гг.
    * * *
    Генов взаимодействие — любые виды взаимодействия между неаллельными генами одного генома или генотипа при формировании определенного фенотипа. Такое взаимодействие часто происходит как взаимодействие продуктов неаллельных генов, соответствующих стадиям последовательных реакций при образовании веществ данного фенотипа. Эти взаимодействия могут вызывать отклонения в соотношениях фенотипов и генотипов в популяции, установленных классическими генетическими методами.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > gene interaction

  • 24 gene mapping

    Определение положения данного гена на какой-либо хромосоме относительно других генов; используют три основные группы методов К.г. физическое (определение с помощью рестрикционных карт, электронной микроскопии и некоторых вариантов электрофореза межгенных расстояний - в нуклеотидах), генетическое (определение частот рекомбинаций между генами, в частности, в семейном анализе и др.) и цитогенетическое (гибридизации in situ in situ hybridization, получение монохромосомных клеточных гибридов monochromosomal cell hybrid, делеционный метод deletion mapping и др.); в генетике человека приняты 4 степени надежности локализации данного гена - подтвержденная (установлена в двух и более независимых лабораториях или на материале двух и более независимых тест-объектов), предварительная (1 лаборатория или 1 анализируемая семья), противоречивая (несовпадение данных разных исследователей), сомнительная (не уточненные окончательно данные одной лаборатории); в Приложении 5 приведена сводка (по состоянию на 1992-93) структурных генов, онкогенов и псевдогенов в геномах человека и - включая некоторые мутации - мыши.
    * * *
    Генов картирование — установление линейной организации генов, определение относительной локализации генов на хромосомах (см. Хромосомные карты) или плазмидах (кольцевая карта сцепления) и относительного расстояния между ними. Генетические карты можно создавать на основе анализа рекомбинации (см. Рекомбинаций частота), принятого в классической генетике, или на основе данных молекулярной генетики, т. е. напрямую используя данные сиквенса ДНК (см. Секвенирование).

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > gene mapping

  • 25 genocopies

    Одинаковые изменения фенотипа, обусловленные аллелями разных генов, а также имеющие место в результате различных генных взаимодействий или нарушений различных этапов одного биохимического процесса с прекращением синтеза конечного продукта, - например, у Drosophila melanogaster известен ряд мутаций неаллельных генов, обусловливающих фенотип «красные глаза" (нарушен синтез коричневого пигмента).
    * * *
    Генокопии — формирование фенотипически сходных признаков (см. Фенотип. Фен) под воздействием генов, расположенных в различных участках хромосомы или в различных хромосомах (ср. Фенокопия). Г. являются следствием взаимодействия генов (см. Генов взаимодействие), нарушений в процессах многоэтапного биосинтеза молекул в клетке, обусловленных мутацией или мутациями, в результате чего возможно отсутствие конечного продукта. Эти изменения могут быть зафиксированы на молекулярном уровне, но признаки (фены) не различаются. Напр., у Dr. melanogaster фенотип «красные глаза» формируется в результате функционирования ряда мутаций неаллельных генов, нарушающих синтез коричневого пигмента.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > genocopies

  • 26 multigene family

    Группа родственных структурных генов, образующих кластер либо диспергированных по геному, возникших в результате ряда последовательных дупликаций гена-предшественника; характерные примеры - М.с. генов рРНК, иммуноглобулинов immunoglobulins, гистонов histones( например, в геноме мышей 15-20 генов, кодирующих гистоны Н2А) и др.
    * * *
    Мультигенное семейство, с. генов — набор структурно и функционально тесно взаимосвязанных генов, происходящих от одного предкового гена путем дупликаций или мутационного процесса (см. Амплификация генов). Могут быть кластеризованы на одной и той же хромосоме (напр., гены, кодирующие рибосомную РНК) или разбросаны по всему геному (гены белков теплового шока). Большинство членов таких мультигенных семейств сохраняют высокую гомологию в кодирующих областях и отличаются друг от друга изменениями в интронных (см. Интрон) и промоторных (см. Промотор) областях.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > multigene family

  • 27 polygenic inheritance

    Наследование количественных признаков, т.е. признаков, выражение которых определяется взаимодействием значительного числа генов (полигенов).
    * * *
    Наследование полигенное — наследование признаков, которые определяются многими генами, обладающими в отдельности слабым действием. Фенотипическое проявление полигенно наследуемого признака в большой степени зависит от условий среды. В случае суммирования эффектов отдельных генов (аддитивная полигения или полимерия) и при сильном влиянии условий внешней среды в расщепляющихся по этому признаку поколениях наблюдаются не четко выраженные, ограниченные фенотипические классы, а непрерывный вариационный ряд по количественному выражению этого признака (см. Количественное наследование). В случае взаимной зависимости генов, контролирующих признак, Н. п. может идти по типу комплементарного (см. Комплементарность) или эпистатического (см. Эпистаз) взаимодействия генов. Если действие генов кумулируется лишь частично или совсем не суммируется, то имеет место действие дупликатных генов.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > polygenic inheritance

  • 28 assortment

    assortment 1. сортировка; 2. ассортимент, выбор; 3. расхождение генов или хромосом в мейозе
    independent assortment независимое расхождение генов или хромосом в мейозе, случайное расхождение генов или хромосом в мейозе
    nonrandom assortment неслучайное расхождение генов или хромосом в мейозе
    random assortment независимое расхождение генов или хромосом в мейозе, случайное расхождение генов или хромосом в мейозе

    English-Russian dictionary of biology and biotechnology > assortment

  • 29 genomic library

    1. геномная библиотека
    2. библиотека генов

     

    библиотека генов
    Полный набор генов данного организма, полученный в составе рекомбинантных ДНК
    [ http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech_Eng-Rus.pdf]

    Тематики

    EN

     

    геномная библиотека
    клонотека
    банк (библиотека) генов
    Набор клонированных фраментов ДНК, представляющих индивидуальный (групповой, видовой) геном; в случае крупных геномов (многие млекопитающие, включая человека, и др.) используют получение хромосомоспецифичных библиотек; понятие «банк генов» не совсем удачно, т.к. оно в большей степении относится к коллекциям селекционируемых генотипов.
    [Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]

    Тематики

    Синонимы

    EN

    Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > genomic library

  • 30 gene flow

    1. поток генов
    2. миграция генов

     

    миграция генов
    Перенос генов от одной популяции другой
    [ http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech_Eng-Rus.pdf]

    Тематики

    EN

     

    поток генов
    Перемещение генов между популяциями, происходящий в результате межпопуляционной гибридизации; величина П.г. изменяет частоту аллелей в популяции и является фактором эволюции.
    [Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]

    Тематики

    EN

    Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > gene flow

  • 31 theory

    теория

    theory of antigenic immaturity of conceptus — теория «иммунологического инфантилизма» плода, теория иммунологической незрелости плода

    theory of globulines transporteurs — теория «транспортных глобулиновых молекул», теория Грабаря

    Alberty-Baldwin theory — теория кумулятивного повреждающего эффекта, математическая теория иммунитета Олберти-Болдуина

    altered antigen theory — теория «изменённого своего» (теория аутоиммунитета, основанная на возможности модификаций в специфичности аутоантигенных детерминант)

    altered-self theory — теория «изменённого своего» (теория аутоиммунитета, основанная на возможности модификаций в специфичности аутоантигенных детерминант)

    Border's theory — теория Борде (теория, объясняющая механизмы реакции антиген-антитело на основе принципов химической связи)

    cellular defence theory — учение о фагоцитозе, теория ( иммунитета) Мечникова, клеточная теория иммунитета

    cross-reactive antigen theory — теория перекрёстнореагирующих [родственных] антигенов (теория аутоиммунитета, основанная на перекрёстной специфичности между некоторыми бактериально-вирусными антигенами и тканевыми аутоантигенами)

    dual recognition theory — теория «двойного распознавания» (гипотеза иммунологического распознавания, основанная на том, что T-лимфоциты имеют два вида рецепторов – для собственных антигенов гистосовместимости и для распознаваемого чужеродного антигена)

    Flory-Stockmayer-Goldberg theory — теория реакции полимеризации, теория Флори-Стокмайера-Гольдберга

    forbidden antigen theory — теория «запрещённых клонов» ( одна из теорий аутоиммунитета)

    forbidden clone theory — теория «запрещённых клонов» ( одна из теорий аутоиммунитета)

    framework theory — теория «решётки», теория реципрокной поливалентности, теория Маррака-Гейдельбергера

    gene exclusion theory — теория исключения генов (теория биосинтеза антител, основанная на элиминации в эмбриогенезе некоторых сегментов иммуноглобулиповых генов)

    germline theory — теория зародышевого пути, зародышевая [гаметическая] теория ( одна из теорий формирования разнообразия иммуноглобулинов)

    immune deficiency theory — теория иммунологической недостаточности (теория развития аутоиммунных болезней вследствие иммунологической гипореактивности)

    immunologic theory of aging — иммунологическая теория старения, теория Вулфорда-Барнета

    information theory — инструктивная [матричная] теория, теория шаблонов, теория Горовица (теория образования антител, основанная на инструктирующей роли антигена в выборе определённого клона антитело-продуцирующих клеток)

    instructive theory — инструктивная [матричная] теория, теория шаблонов, теория Горовица (теория образования антител, основанная на инструктирующей роли антигена в выборе определённого клона антитело-продуцирующих клеток)

    Jerne's theory — теория естественного отбора ( антителопродуцирующих клонов), клонально-селекционная теория ( иммунитета), теория Ерне

    lateral-chain theory — теория боковых цепей, теория ( иммунитета) Эрлиха, «рецепторная» теория

    lattice theory — теория «решётки», теория реципрокной поливалентности, теория Маррака-Гейдельбергера

    Lederberg's theory — селекционная теория образования антител на субклеточном уровне, теория Ледерберга

    lock-and-key theory — теория «ключа и замка», теория Фишера

    Marrack-Heidelberger theory — теория «решётки», теория реципрокной поливалентности, теория Маррака-Гейдельбергера

    Metchnikoff's theory — учение о фагоцитозе, теория ( иммунитета) Мечникова, клеточная теория иммунитета

    monophyletic theory — унитарная [монофилетическая] теория ( кроветворения)

    mutual multivalence theory — теория «решётки», теория реципрокной поливалентности, теория Маррака-Гейдельбергера

    neoantigen theory — теория «изменённого своего» (теория аутоиммунитета, основанная на возможности модификаций в специфичности аутоантигенных детерминант)

    occlusion theory — «окклюзионная» теория, теория Бойда (объясняющая механизм иммунопреципитации на основе физического слипания взаимодействующих молекул)

    plus-minus network theory — теория симметрии иммунных взаимодействий (напр. теория идиотипической сети Ерне)

    reciprocal valency theory — теория «решётки», теория реципрокной поливалентности, теория Маррака-Гейдельбергера

    sequestration antigen theory — теория «забарьерных» [секвестрированных] антигенов (теория аутоиммунитета, основанная на существовании скрытых от иммунной системы органных или тканевых аутоантигенов)

    shared antigen theory — теория перекрёстнореагирующих [родственных] антигенов (теория аутоиммунитета, основанная на перекрёстной специфичности между некоторыми бактериально-вирусными антигенами и тканевыми аутоантигенами)

    side-chain theory — теория боковых цепей, теория ( иммунитета) Эрлиха, «рецепторная» теория

    single hit theory — «одноударная» гипотеза ( феномена иммунного гемолиза)

    template theory — инструктивная [матричная] теория, теория шаблонов, теория Горовица (теория образования антител, основанная на инструктирующей роли антигена в выборе определённого клона антитело-продуцирующих клеток)

    Thomas-Burnet theory — теория иммунологического надзора, теория Томаса-Барнета

    trained enzymes theory — теория «инструктируемых ферментов» ( теория образования антител Барнета-Феннера)

    Англо-русский словарь по иммунологии > theory

  • 32 dosage compensation

    компенсация дозы [генов]
    Механизм регуляции экспрессии генов, сцепленных с полом; при механизме определения пола XX-XY у самок К.д. связана с инактивацией одной из Х-хромосом X-inactivation( при полисомии polysomy по Х-хромосоме - всех Х-хромосом кроме одной), образующей интерфазное тельце Барра (sex chromatin); к К.д. относят и более сложные внутригеномные взаимоотношния, связанные с регуляционно-репрессорными механизмами (см. autosomal dosage compensation).
    * * *
    Дозы компенсация — механизм регуляции экспрессии сцепленных с полом генов при XX-XY или XX-XO типах определения пола (см. Пола определение), когда фенотипическая реализация локусов, находящаяся в X-хромосомах, у обоих полов идентична при наличии разных доз генов (у самок доза каждого гена в 2 раза больше). У Drosophila melanogaster Д. к. осуществляется за счет увеличения в два раза скорости транскрипции генов на единственной X-хромосоме самцов по сравнению с самками. У животных Д. к. достигается путем инактивации одной из X-хромосом в соматических клетках самок. Инактивированные X-хромосомы образуют тельца Барра, или половой хроматин. В случае множественности X-хромосом (в полиплоидных клетках) функционирует только одна к.-л. хромосома, остальные инактивированы. К Д. к. относят и более сложные внутригеномные взаимоотношения, связанные с реляционно-репрессорными механизмами. Долло закон

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > dosage compensation

  • 33 enhancer

    Специфическая цис-действующая последовательность нуклеотидов, многократно усиливающая транскрипцию генов РНК-полимеразой II; например, у вируса SV40 размер Э. - 72 пары нуклеотидов: он может усиливать транскрипцию -глобинового гена в 200 раз, даже находясь на значительном удалении от него и в любой ориентации по отношению к промотору promoter; способность ряда Э. взаимодействовать со специфическими белками в дифференцированных клетках обеспечивает тканеспецифичный характер экспрессии соответствующих генов; считается, что Э. является одной из форм мобильных генетических элементов transposable elements; один из Э. Spm-элемент Spm element.
    * * *
    Усилитель — ген-модификатор, усиливающий фенотипическое проявление др. гена. Син. Энхансер.
    Энхансер, усилитель
    1. Последовательность ДНК размером 50 — 100 п.о., имеющая важное значение для эффективной транскрипции многих вирусных, растительных и животных генов и функционирующая независимо от ее ориентации и положения в ДНК. Может влиять на экспрессию генов в цис-, а иногда и в трансположении. Э. найдены в 5'- (апстрим Э.) и 3'- (даунстрим Э.) позициях экспрессирующихся генов, а также внутри интронов (см.; внутренний Э.) и кодирующих районов (даунстрим Э.). Э. проявляют клеточную специфичность.
    2. Транспозибельный (мобильный) элемент (см. Транспозон) кукурузы (En-Э.) размером 8,3 кб, содержащий совершенные, инвертированные концевые повторы размером в 13 п. о. и две открытые рамки считывания ORF1 и ORF2, которые кодируют как минимум два белка (tnpA и tnpB). Син. Усилитель.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > enhancer

  • 34 gene cluster

    Группа повторов одного и того же или родственных генов, расположенных рядом на хромосоме, входящих в состав мультигенного семейства multigene family.
    * * *
    1. Группа генов, входящих в семью мультигенов (см. Мультигенное семейство).
    2. Повторы одного и того же или родственных генов, расположенных на хромосоме рядом.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > gene cluster

  • 35 genomic library

    геномная библиотека, клонотека, банк (библиотека) генов
    Набор клонированных фраментов ДНК, представляющих индивидуальный (групповой, видовой) геном genome; в случае крупных геномов ( многие млекопитающие, включая человека, и др.) используют получение хромосомоспецифичных библиотек chromosome-specific library; понятие «банк генов» не совсем удачно, т.к. оно в большей степении относится к коллекциям селекционируемых генотипов.
    * * *
    Генов библиотека, г. банк — коллекция произвольно клонированных фрагментов геномной ДНК организма (см. Геномная библиотека) или специальный набор фрагментов ДНК, представляющих, напр., коллекцию иРНК (см. РНК информационная), экспрессирующуюся в клетке в определенное время. В таких библиотеках фрагменты инсерцируются (включаются) в подходящий вектор, напр. космидные (см. Космида) или бактериальные векторы, и трансформируются (см. Трансформация) в подходящего хозяина. В идеале геномная библиотека должна содержать практически весь геном вида, из которого она происходит, а библиотека кДНК — все различные молекулы иРНК данной клетки на одной и той же стадии развития. Если в Б.г. представлены все гены организма (то есть вероятность отсутствия какого-либо участка генома не превышает 0,01%), она называется педставительной библиотекой генов. Сейчас сконструировано множество типов генных библиотек для различных целей исследования.
    Геномная библиотека, банк генов — набор клонированных (см. Клонирование) фрагментов ДНК, представляющих индивидуальный (групповой, видовой) геном. У млекопитающих (в т. ч. у человека) геномы крупные, поэтому для них создают хромосомоспецифичные библиотеки (см. Хромосомная библиотека).

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > genomic library

  • 36 heredity

    Свойство организмов обеспечивать структурную и функциональную преемственность поколений путем передачи биологических признаков от одного поколения другому; в ряду поколений у всех организмов Н. - явление строго непрерывное, обеспечивается наличием материальной субстанции, детерминирующей развитие биологических признаков, а именно генов gene.
    * * *
    1. Строго непрерывная передача и проявление биологических признаков родителей у потомства, обеспечиваемая наличием материальных носителей Н. — генов, которые детерминируют развитие этих признаков.
    2. Передача генетической информации одним поколением другому. Типы и характер Н. зависят от типа воспроизведения наследственного материала (см. Транскрипция. Трансляция), от локализации генов (в ядре или цитоплазме, сцепление с полом) и их взаимодействия друг с другом (см. Генов взаимодействие), от числа генов, детерминирующих определенный признак (моногенный или полигенный контроль). Н. характеризуется константностью и изменчивостью. Константность Н. обеспечивается идентичным или точно копирующим воспроизведением носителя наследственности (гены, хромосомы), а ее изменчивость связана, с одной стороны, с мутациями наследственных структур, а с другой — с перестройками генетической системы в целом, объединяющей эти структуры. Т.обр., Н. представляет собой целый комплекс явлений, обусловленных как носителями Н., так и закономерностями проявления наследственных задатков.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > heredity

  • 37 pervasive gene action

    Действие генов, сказывающееся на всех клетках (в отличие от локализованного действия генов, проявляющегося более или менее отчетливо только локально - в группе клеток, в отдельных тканях, органах и т.п.); термины «П.д.г.", «локализованное действие генов", а также «имманентное действие генов» предложены К.Уоддингтоном в 1947.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > pervasive gene action

  • 38 gene cluster

    1) Биология: кластер генов
    2) Медицина: скопление генов
    3) Генетика: кластер генов (группа повторов одного и того же или родственных генов, расположенных рядом на хромосоме, входящих в состав мультигенного семейства)

    Универсальный англо-русский словарь > gene cluster

  • 39 random assortment

    2) Медицина: независимое расхождение генов или хромосом в мейозе (случайное), независимое расхождение генов или хромосом (в мейозе), случайное расхождение генов или хромосом (в мейозе), независимое расхождение генов в мейозе (случайное), независимое расхождение хромосом в мейозе (случайное)
    3) Генетика: случайное распределение (хромосом; независимый характер распределения материнских и отцовских хромосом в гаплоидных гаметах у особи, полученной от данных родителей)

    Универсальный англо-русский словарь > random assortment

  • 40 Bioinformatics

    Биоинформатика — новое направление исследований, использующее математические и алгоритмические методы для решения молекулярно-биологических задач. В отечественной генетике зарождение этого направления тесно связано со становлением и развитием Института цитологии и генетики СО АН СССР в Новосибирском Академгородке. Первая международная конференция по Б. регуляции и структуры генома в странах СНГ была организована и проведена в этом институте (24–31 августа 1998 г.). Совершенствование экспериментальных методов приводит к экспоненциальному росту молекулярно-биологических данных и возникновению абсолютно новой для биологии междисциплинарной задачи анализа и хранения информации из лабораторий, рассеянных по всему миру. Задачи Б. можно определить как развитие и использование математических и компьютерных методов для решения проблем молекулярной биологии. Выделяют: (1) Задачу поддержания и обновления баз данных. Современная эра в молекулярной биологии началась с момента открытия двойной спирали Уотсоном и Криком в 1953 г. Эта революция породила большой объем данных полученных прямым чтением ДНК из разных участков геномов. Быстрое секвенирование стало возможно 10 лет назад, первый полностью секвенированный геном — геном бактерии Haemophilus influenzae, 1800 т.п.н. В 1996 г. закончено секвенирование первого генома эукариот, генома дрожжей (10 млн п.н.) и секвенирование продолжается со скоростью более 7 миллионов нуклеотидов в год. Знание геномной ДНК в значительной мере сделало возможным ряд фундаментальных биологических открытий, таких как интроны, самосплайсирующиеся РНК (см. РНК-процессинг), обратная транскрипция и псевдогены. Однако существующие базы данных не вполне адекватны требованиям молекулярных биологов: одной из нерешенных проблем является создание программного обеспечения для простого и гибкого доступа к данным. (2) Другой класс задач в большей степени ориентирован на поиск оптимальных алгоритмов для анализа последовательностей. Типичным примером такой задачи является задача выравнивания: как выявить сходство между двумя последовательностями, зная их нуклеотидный состав? Задача решается множество раз в день, поэтому нужен оптимальный алгоритм с минимальным временем выравнивания. (3) Можно также выделить ряд направлений современной Б.: создание и поддержка баз данных (БД) регуляторных последовательностей и белков; БД по регуляции генной экспрессии; БД по генным сетям; компьютерный анализ и моделирование метаболических путей; компьютерные методы анализа и распознавания в геноме регуляторных последовательностей; методы анализа и предсказания активности функциональных сайтов в нуклеотидных последовательностях геномов; компьютерные технологии для изучения генной регуляции; предсказания структуры генов; моделирование транскрипционного и трансляционного контроля генной экспрессии; широкомасштабный геномный анализ и функциональное аннотирование нуклеотидных последовательностей; поиск объективных методов аннотирования и выявления различных сигналов в нуклеотидных последовательностях; эволюция регуляторных последовательностей в геномах; характеристики белковой структуры, связанные с регуляцией; экспериментальные исследования механизмов генной экспрессии и развитие интерфейса, связывающего экспериментальные данные с компьютерным анализом геномов. Первые работы по компьютерному анализу последовательностей биополимеров появились еще в 1960-1970-х годах, однако формирование вычислительной биологии как самостоятельной области началось в 1980-х годах после развития методов массового секвенирования ДНК. С точки зрения биолога-экспериментатора, можно выделить пять направлений вычислительной биологии: непосредственная поддержка эксперимента (физическое картирование (см. Физическая карта), создание контиг (см.) и т.п.), организация и поддержание банков данных, анализ структуры и функции ДНК и белков, эволюционные и филогенетические исследования, а также собственно статистический анализ нуклеотидных последовательностей. Разумеется, границы между этими направлениями в значительной мере условны: результаты распознавания белок-кодирующих областей используются в экспериментах по идентификации генов, одним из основных методов предсказания функции белков является поиск сходных белков в базах данных, а для осуществления детального предсказания клеточной роли белка необходимо привлекать филогенетические соображения. В 1982 г. возникли GenBank и EMBL — основные банки нуклеотидных последовательностей. Вскоре после этого были созданы программы быстрого поиска по банку — FASTA и затем BLAST. Позднее были разработаны методы анализа далеких сходств и выделения функциональных паттернов в белках. Оказалось, что даже при отсутствии близких гомологов, можно достаточно уверенно предсказывать функции белков. Эти методы с успехом применялись при анализе вирусных геномов, а затем и позиционно клонированных генов человека. Алгоритмы анализа функциональных сигналов в ДНК ( промоторов, операторов, сайтов связывания рибосом) менее надежны, однако и они в ряде случаев были успешно применены, напр., при анализе пуринового регулона Escherichia coli. Идет активная работа над созданием алгоритмов предсказания вторичной структуры РНК. Алгоритмические аспекты этой проблемы были разрешены достаточно быстро, однако оказалось, что точность экспериментально определенных физических параметров не позволяет осуществлять надежные предсказания. В то же время, сравнительный подход, позволяющий построить общую структуру для группы родственных или выполняющих одну и ту же функцию РНК, дает существенно более точные результаты. Другим важным достижением, связанным с рибосомальными РНК, стало построение эволюционного древа прокариот и вытекающей из него естественной классификации бактерий, используемой в банках нуклеотидных последовательностей, в частности GenBank. Статистическая информация (в виде предсказания GenScan), последовательности гомологичных белков и последовательности EST являются исходным материалом для предсказания генов в последовательностях ДНК человека программой ААТ. Алгоритмы, объединяющие анализ функциональных сигналов в нуклеотидных последовательностях и предсказание вторичной структуры РНК, используются для поиска генов тРНК и самосплайсирующихся интронов. Одновременный анализ белковых гомологий и функциональных сигналов позволил получить интересные результаты при эволюцию системы репликации по механизму катящегося кольца. Опыт показывает, что надежное предсказание функции белка по аминокислотной последовательности возможно лишь при одновременном применении разнонаправленных программ структурного и функционального анализа. Основное — это приближение теоретических методов к биологической практике. Во-первых, вновь создаваемые алгоритмы все ближе имитируют работу биолога. В частности, был формализован итеративный подход к поиску родственных белков в банках данных, позволяющий работать со слабыми гомологиями и искать отдаленные члены белковых семейств. При этом все члены семейства, идентифицированные на очередном шаге, используются для создания очередного образа семейства, являющегося основой для следующего запроса к базе данных. Другим примером являются алгоритмы, формализующие сравнительный подход к предсказанию вторичной структуры регуляторных РНК. Во-вторых, создаваемые алгоритмы непосредственно приближаются к экспериментальной практике. Так, повышение избирательности методов распознавания белок-кодирующих областей (возможно, за счет уменьшения чувствительности) позволяет осуществлять предсказание специфичных гибридизационных зондов и затравок ПЦР. Наконец, развитие Интернета — электронной почты и затем WWW — сняло зависимость от модели компьютера и операционной системы и сделало программы универсальным рабочим инструментом.

    Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Bioinformatics

Страницы

См. также в других словарях:

  • Генов — Генов  болгарская фамилия. Известные носители фамилии Генов, Антоний (р. 1950 г.)  болгарский артист. Генов, Борислав Стефанов (р. 1926)  Полковник войск связи Болгарской Народной Армии. Генов, Гаврил Димитров (псевдоним… …   Википедия

  • генов поток — * генаў паток * gene flow обмен генами между разными популяциями одного и того же вида за счет мигрантов, что приводит к временному изменению частоты генов многих локусов в общем пуле генов (см. ) популяции реципиента (см. ). Генов распределение… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • генов мечение — * генаў мечанне * gene tagging or targeting метод изолирования мутировавшего гена путем инсерции (см.) короткой чужеродной последовательности ДНК (напр., транспозона) с использованием гибридизационных зондов (см. ) с высокой гомологией для его… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • Генов, Явор Бориславов — Эта страница требует существенной переработки. Возможно, её необходимо викифицировать, дополнить или переписать. Пояснение причин и обсуждение на странице Википедия:К улучшению/30 октября 2012. Дата постановки к улучшению 30 октября 2012. Явор… …   Википедия

  • Генов, Борислав Стефанов — В Википедии есть статьи о других людях с такой фамилией, см. Генов. Борислав Стефанов Генов Дата рождения 30 марта 1926(1926 03 30) Место рождения село Друган, Радомирская околия, Перникская область, Болгария …   Википедия

  • Генов, Петар Генков — Петар Генков Генов Петър Генков Генов Страны …   Википедия

  • ГЕНОВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ — Происходит всегда, когда наследуемые признаки обусловлены более, чем одним геном, независимо от того, являются ли эти гены аллельными или неаллельными. Большинство фенотипических признаков результат взаимодействия генов. Возможны взаимодействия… …   Термины и определения, используемые в селекции, генетике и воспроизводстве сельскохозяйственных животных

  • ГЕНОВ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ НЕЗАВИСИМОЕ — Независимое, совершающееся по законам теории вероятности распределение генов, локализованных в разных парах хромосом, по гаметам во время мейоза …   Термины и определения, используемые в селекции, генетике и воспроизводстве сельскохозяйственных животных

  • Генов — (псевдоним Цонев)         Гаврил Димитров (1.2.1892, с. Живовци, Михайловградский округ, 20.1.1934, Москва), деятель болгарского рабочего движения. Сын крестьянина бедняка. Работал сельским учителем, принимал участие (с 1912) в деятельности… …   Большая советская энциклопедия

  • ГЕНОВ — (псевд. Цонев), Гаврил (1.II.1892 20.I.1934) деятель болг. рабочего движения. Сын крестьянина бедняка. Работал сел. учителем, принимал участие (с 1912) в деятельности Видинской учительской орг ции Болг. с. д. партии (тесных социалистов). Во время …   Советская историческая энциклопедия

  • Генов — прізвище …   Орфографічний словник української мови

Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
… Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»