-
121 DNA Probes
ДНК-ЗондыЗонд для нуклеиновой кислоты – короткоцепочечная ДНК, которая обнаруживает и связывает комплементарную последовательность в образцах, содержащих одноцепочечные фрагменты ДНК или РНК, что позволяет определять целевые последовательности. Анализ с использованием зондов основан на важнейшей реакции гибридизации, протекающей спонтанно между двумя комплементарными цепями ДНК/ДНК или ДНК/РНК. Как и в иммуннохимическом анализе, для обнаружения гибрида необходимо, чтобы зонд содержал метку. Для обнаружения гибрида были разработаны различные прямые и косвенные методы. Прямая маркировка предполагает непосредственное присоединение метки к последовательности зонда. Косвенное мечение - связывание антитела с гибридом ДНК/ДНК или ДНК/РНК. Как и в иммунохимическом анализе, более предпочтительны зонды, где метка не является радиоактивной, главным образом ввиду радиационной опасности, сложностей утилизации и небольшого срока хранения реагента последних. Кроме того, факторы, влияющие на предел обнаружения гибридизации проб, содержащих меченые зонды, схожи с факторами, характерными для иммунохимического анализа. Поэтому разработка простой, недорогой и чувствительной системы прямого обнаружения, не связанной с мечением, очень желательна. -
122 белки
proteins; albuminsСложные органические вещества ( полипептиды), состоящие из аминокислот, соединённых пептидными ( амидными) связями; важнейшие компоненты живой клетки (см. также альбумины).
Продукт Staphylococcus aureus, способный связывать иммуноглобулин G; используется для измерения клеточных антигенов и антител. Образует комплексы с антителами, не нарушая их связывания с антигеном. В иммобилизованной форме используется в аффинной хроматографии для разделения подклассов иммуноглобулинов, а также в различных типах иммунопроб.
Ферменты, имеющиеся во всех путях биосинтеза и ряде путей катаболизма. Кроме катаболитических центров, распознающих и связывающих субстраты, у аллостерических белков есть и другие стереоспецифические участки – аллостерические центры, а именно места связывания эффекторов, изменяющих сродство фермента к субстрату. Аллостерические эффекторы представляют собой низкомолекулярные соединения, конечные продукты биосинтеза или такие вещества, как АТФ, АДФ, АМФ, ацетил-КоА, фосфоенолпируват и NADH.
Образование белков из аминокислот; осуществляется путём последовательной поликонденсации отдельных аминокислотных остатков, начиная с амино-N-конца полипептидной цени в направлении к карбоксильному C-концу.
Общий термин для белков вирусной частицы и белков, индуцированных вирусом.
Полипептиды, образуемые экспрессией гибридного гена.
Белки, характеризующиеся более сложным способом свёртывания цепи по сравнению с фибриллярными. Эти белки сохраняют свою структуру преимущественно за счёт взаимодействия гидрофобных остатков. Примеры: миоглобин, лизоцим, карбоксипептидаза A.
Белки, потерявшие свою естественную конфигурацию при воздействии дестабилизирующего агента, например тепла (см. также денатурация).
белки, дестабилизирующие спираль — helix-destabilizing proteins, HDP
Специфичные белки, связывающиеся с разделяющимися нитями двойной спирали ДНК в вилке репликации для поддержания ДНК в «расплетённом» состоянии.
Входят в состав электрон-транспортных цепей ( участвуют в переносе протонов и электронов). Они содержат негеминовое железо, с одной стороны, связанное с атомами серы остатков цистеина, а с другой – с неорганической сульфидной серой. Помимо транспорта электронов в мембранах, эти белки участвуют в фиксации молекулярного азота, в восстановлении сульфита и нитрита, в фотосинтезе, в освобождении и активации молекулярного водорода и в окислении алканов. Железосерные белки имеют небольшую молекулярную массу ( порядка 10 кДа) и сильно отрицательный окислительно-восстановительный потенциал (см. также ферредоксины).
Различают два типа железосодержащих белков: гемопротеины и белки с негемовым железом. Первый негемовый железосодержащий белок – ферредоксин был выделен из клостридий. В настоящее время известно большое семейство белков с негемовым железом.
Встроенные в мембрану внутренние белки; амфипатические молекулы, имеют центральное гидрофобное ядро, взаимодействующее с жирнокислотными цепями и гидрофильные концы, контактирующие с клеточным содержимым и с окружением. Часто эти белки имеют углеводные цепи, присоединённые к той части молекулы, которая выступает во внеклеточную среду.
Белки, которые встроены в клеточную мембрану или мембрану клеточной органеллы или ассоциированы с ней. Молекулярная масса мембранных белков обычно варьирует в пределах от 10 кДа до 240 кДа.
Белок в своем естественном, in vivo состоянии, в противоположность денатурированному.
Структурный белок, из которого состоит оболочка вируса ( фага) и клеток микроорганизмов.
белки одноклеточных — single cell protein, SCP
Продукт выращивания дрожжей, бактерий, грибов или водорослей ради их белкового содержимого; используется в продуктах питания и животном корме, поскольку содержит углеводы, жиры, витамины и минеральные вещества.
Мембранные белки, но в отличие от интегральных ( внутренних) белков они не пронизывают мембрану и связаны с ней менее прочно.
Расщепление сигнальной последовательности, регулирующей прохождение белка через мембрану клетки или органеллы.
Белки, состоящие только из аминокислот.
Белки, осуществляющие гидролиз других белков. Продукты жизнедеятельности бактерий (например, Bacillus subtilis) и грибов. Используются в качестве добавки к моющим средствам, в кожевенной промышленности при дублении кожи, в научно-исследовательской практике.
Белки-посредники, обеспечивающие для эффекторов взаимодействие с ДНК (см. также репрессор и апорепрессор).
Процесс, обратный денатурации, при котором белки возвращают свою нативную ( биологически активную) пространственную структуру (см. также ренатурация).
Белки, входящие в состав рибосомы. Рибосомные белки характеризуются глобулярной компактной конформацией с развитой вторичной и третичной структурой; они занимают преимущественно периферическое положение в ядре, состоящем из рибосомной РНК (см. также рибосомный).
Растворимые белки, которые специфически и обратимо связывают различные вещества, включая сахара, аминокислоты, неорганические ионы и витамины.
Аналитический метод, используемый для определения последовательности аминокислот, составляющих пептид или белок (см. также секвенирование).
Химический метод синтеза пептидных связей (предложен в 1960 г. Мерифильдом, США). Этот метод получил название твёрдофазного синтеза пептидов. Метод Мерифильда прост в техническом оформлении, что позволяет полностью автоматизировать процесс.
сложные белки — conjugated proteins, proteids
Белки, содержащие помимо аминокислот небелковые компоненты, а именно ионы металла или органические молекулы – липиды, углеводы или нуклеиновые кислоты.
Белки, функционирующие как структурные компоненты клетки.
Гистоны - структурные белки эукариотических хромосом; относительно небольшие белки с очень большой долей положительно заряженных аминокислот ( лизина и аргинина); положительный заряд помогает гистонам прочно связываться с ДНК ( которая заряжена сильно отрицательно) независимо от её нуклеотидной последовательности (см. также хромосомный).
-
123 (+)-цепь
Genetics: (+) strand (одноцепочечная кольцевая молекула ДНК фага (например, Т4), участвующая в образовании репликативной формы ; последовательности нуклеотидов в В. ц. идентичны последовательности соответствующих мРНК), viral strand (одноцепочечная кольцевая молекула ДНК фага (например, Т4), участвующая в образовании репликативной формы ; последовательности нуклеотидов в В. ц. идентичны последовательности соответствующих мРНК) -
124 РНК
Одна из нуклеиновых кислот; биополимер, состоящий из нуклеотидов, содержащих рибозу; РНК находится преимущественно в рибосомах, в меньшем количестве присутствует в ядре и митохондриях; играет важную роль в биосинтезе белка в клетке.
Присоединение аминокислоты к 3'-концевому аденозину молекулы тРНК с образованием аминоацил-тРНК; катализируется ферментом аминоацил-тРНК-синтетазой.
гетерогенная ядерная РНК — heterogeneous nuclear RNA, hnRNA
РНК с большой молекулярной массой, продукт первичной транскрипции эукариотных структурных генов. Содержит последовательности экзонов и интронов, превращается в иРНК при элиминации интронов.
Осуществляется путём щелочного гидролиза.
Фермент, катализирующий синтез РНК.
информационная РНК — messenger RNA, mRNA
Форма РНК, осуществляющая передачу записанной в ДНК информации к местам синтеза белка, состоит из одной цепи и содержит от одной до десяти тысяч пар оснований.
матричная РНК — messenger RNA, mRNA
РНК-полимераза — RNA polymerase (см. также полимераза)
Образование рРНК при расщеплении спейсерных (см. также спейсер) последовательностей.
Образование функционально активных молекул из более длинного предшественника, который подвергается расщеплению и модификации с включением минорных оснований.
РНК, растворимая при низких значениях рН; к растворимым РНК относятся матричная и транспортная РНК.
Копирование генетической информации, содержащейся в РНК вирусного генома; катализируется РНК-репликазами. Образующиеся молекулы РНК служат далее матрицами для синтеза РНК молекул потомков.
рибосомная РНК — ribosomal RNA, rRNA
РНК, нековалентно связанная с рибосомными белками в обеих рибосомных субъединицах и составляющая около 80% общей клеточной РНК.
Синтез молекул РНК, включает стадии инициации, элонгации и терминации.
Образование молекул рРНК, обусловленное посттранскрипционным процессингом предшественников (см. также процессинг).
Удаление последовательностей РНК, соответствующих интронам ДНК, и соединение участков, которые транскрибированы с кодирующих последовательностей ( экзонов).
РНК-транскриптаза — RNA transcriptase (см. также транскриптазы)
транспортная РНК — transfer RNA, tRNA
Низкомолекулярная молекула РНК ( содержит 75-90 нуклеотидов), связывающая аминокислоту и переносящая её к рибосомам для включения в полипептидную цепочку при трансляции.
Стадия транскрипции, которая наступает после присоединения около восьми рибонуклеотидов.
-
125 -цепь
Genetics: (+) (+) strand (одноцепочечная кольцевая молекула ДНК фага (например, Т4), участвующая в образовании репликативной формы ; последовательности нуклеотидов в В. ц. идентичны последовательности соответствующих мРНК), (+) viral strand (одноцепочечная кольцевая молекула ДНК фага (например, Т4), участвующая в образовании репликативной формы ; последовательности нуклеотидов в В. ц. идентичны последовательности соответствующих мРНК) -
126 ферменты
Вещества белковой природы, присутствующие во всех живых клетках, направляющие, регулирующие и многократно ускоряющие биохимические процессы в них; играют важнейшую роль в метаболизме (см. также биокатализаторы).
Механизм повышения активности ферментов непосредственным воздействием на него путём связывания молекулы активатора в аллостерическом сайте на фермент, что приводит к изменению конфигурации фермента и в результате – к изменению формы активного сайта. Фермент может быть активирован химической модификацией, в свою очередь активированной ферментом.
Способность данного ферментного препарата катализировать специфическую реакцию. Активность может быть выражена числом молей превращаемого субстрата или продукта на единицу времени и единицу массы белка (например, микромоли на милиграмм белка в минуту).
Ферменты, обнаруживающие необычные кинетические свойства в ответ на изменения в концентрации субстрата и/или в ответ на действие аллостерических эффекторов, которые не являются субстратами.
Ферменты, участвующие в анаболических реакциях обмена веществ.
гидролитические ферменты — hydrolytic enzymes, digestive enzymes, hydrolases
Ферменты, катализирующие реакцию гидролиза.
Количество фермента, которое катализирует трансформацию одного микромоля субстрата в единицу времени ( например в 1 мин) при определённой температуре, pH и концентрации субстрата.
Форма ДНК-полимеразы, способная восстанавливать последовательности оснований.
иммобилизованные ферменты — immobilized enzymes (см. также иммобилизация)
Механизм инактивации ферментов химическим агентом.
Синтез фермента в ответ на действие индуцируемого агента, который стимулирует экспрессию генов, кодирующих белок со специфичной ферментной функцией.
Ферменты, образующиеся в ответ на индуцирующий агент. Механизм индукции зависит от действия индуктора на транскрипцию и трансляцию, а не на сам фермент.
Ферменты, участвующие в катаболических реакциях обмена веществ.
Систематизация ферментов по субстрату, с которым они вступают в реакцию, и типу катализируемой ими реакции.
Ферменты, образующиеся непрерывно вне зависимости от условий среды.
Ферменты, проявляющие активность только при изменении условий.
Ферменты, катализирующие реакцию гидролиза.
Ферменты, локализация которых известна. Проба на эти ферменты может использоваться при выделении или очистке субклеточных фракций.
Методы отделения и очистки ферментов, включающие отделение твёрдых веществ, мембранную фильтрацию, абсорбционную хроматографию, гель-фильтрацию и т. д.
Ферменты, расщепляющие пектины; образуются бактериями и грибами. В промышленности для получения пектолитических ферментов используются Aspergillus niger и Sclerotinia libertiana; применяются в технических целях, например для осветления фруктовых соков (см. также пектинэстеразы).
Ферменты, присутствующие в свободной или связанной форме в периплазматическом пространстве.
Ферменты, гидролизующие белки с образованием аминокислот.
Белок, связывающийся с цепочками ДНК в растущей точке вилки репликации в процессе репликации двухцепочечной ДНК.
Фермент, сохраняющий или восстанавливающий спиральную структуру двунитевой ДНК в процессе репликации кольцеобразной молекулы ДНК.
Ферменты с регуляторной функцией в метаболизме.
Оптимизация процессов метаболизма, осуществляемая с помощью регуляции ферментов на двух уровнях:
1) экспрессии генов и синтеза белка путем индукции и репрессии;
2) на ферментном уровне путём ингибирования или активации фермента в результате связывания молекулы эффектора в аллостерическом сайте на ферменте.
Ферменты, катализирующие замещение дефектных участков цепей двойной спирали ДНК (см. также полимераза и эндонуклеазы).
Механизм, предотвращающий синтез ферментов путём образования репрессоров, которые связываются с ДНК, препятствуя транскрипции.
ферменты рестрикции — restriction enzymes, restriction endonucleases
Ферменты, катализирующие расщепление инфицирующей фаговой ДНК; благодаря своему нуклеазному действию они препятствуют проникновению чужеродной ДНК в бактериальную клетку (см. также рестриктазы и эндонуклеазы).
Способность ферментов отличать свой истинный субстрат от других родственных молекул, обусловленная высокой специфичностью фермент-субстратных взаимодействий.
Фермент, содержащийся в желудке млекопитающих; препарат химозин, получаемый из этого фермента, используется для свертывания молока в сыроварении.
Активность ферментов, выраженная как количество или число молей субстрата, превращаемого в единицу времени на единицу веса белка.
Отделение ферментов от загрязняющих материалов с целью повышения их удельной активности. Используются два способа: отделение фермента от твёрдой субстратной культуры; выделение фермента из микробных клеток. Экстрацеллюлярные ферменты отделяются простым отмыванием. Для выделения внутриклеточных ферментов клетки должны быть разрушены химическими, биохимическими или механическими методами (см. также дезинтеграция).
Русско-английский словарь терминов по микробиологии > ферменты
-
127 транспозон
transposon (сокр. Tn)[лат. transpositio — перестановка]семейства повторяющихся элементов ДНК размером от 1 до 20 тыс. п.н., обладающих способностью перемещаться в геноме из одного сайта хромосомы в другой сегмент хромосомы или плазмиду. Т. имеются у бактерий, растений и животных. Они перемещаются с участием комплекса белков, в первую очередь фермента транспозазы (см. транспозаза), который узнает элемент и обеспечивает его перенос на новое место. Т. ограничены с двух сторон инвертированными повторами (см. инвертированные концевые повторы). Эти повторы необходимы для перемещения элемента, которое осуществляется благодаря их сближению друг с другом и узнаванию транспозазой. Вырезание Т. транспозазой может происходить точно — с восстановлением исходной структуры участка ДНК, и неточно, то есть с делециями и вставками от одного до нескольких нуклеотидов, что приводит к появлению стабильных мутаций. Транспозаза может кодироваться как самим подвижным элементом, который будет перемещаться, так и другой копией элемента, локализованной в том же геноме в отдалении. У высших эукариот на долю Т. приходится примерно 10 % ДНК клетки. Большинство их перемещается изредка, но, поскольку их в клетке большое множество, транспозиция оказывает значительное влияние на разнообразие видов. У бактерий обнаружены 2 класса подвижных генов, различающихся по длине и сложности организации:1) инсерционные последовательности, или IS-элементы, имеющие длину около 1 тыс. п.н. и содержащие только ген, отвечающий за их перемещение (см. инсерционные последовательности);2) элементы длиной от 3 до 20 тыс. п.н., которые кроме гена транспозазы содержат ряд дополнительных генов, отвечающих за устойчивость бактерий к антибиотикам (см. антибиотики), тяжелым металлам и др. токсическим веществам. Т. могут участвовать в горизонтальном переносе генов; они служат весьма эффективными векторами для искусственного переноса генов и мутагенеза. Т. впервые был открыт в 40-х гг. прошлого века Б. Мак-Клинток у кукурузы (Нобелевская премия за 1983 г.).см. также ретротранспозонТолковый биотехнологический словарь. Русско-английский. > транспозон
-
128 геликаза-зависимая изотермическая амплификация
сокр. ГЗА[греч. helix (helikos) — спираль; греч. iso — равный и therme — тепло; лат. amplificatio — распространение, увеличение]метод амплификации ДНК in vitro (см. амплификация (1)), который моделирует механизм репликации ДНК in vivo. Первоначально цепи ДНК разделяют с помощью ДНК-геликазы (см. ДНК-геликаза), затем разделенные цепи покрывают белком, связывающимся с одноцепочечными ДНК (SSB), и после гибридизации со специфическими праймерами (см. праймер (1)), отжигающимися по концам нуклеотидной последовательности-мишени, осуществляют синтез новых цепей ДНК с использованием ДНК-полимеразы. Образующиеся двухцепочечные молекулы вновь расплетаются геликазой и т.д. Такая цепная реакции, протекающая при постоянной температуре, ведет в конечном итоге к экспоненциальной амплификации мишени. Метод Г.-з.и.а. предложен в 2004 г. M. Винсентом, Я. Ксу и Х. Конгом.Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский. > геликаза-зависимая изотермическая амплификация
См. также в других словарях:
расшифровка последовательности ДНК — секвенирование ДНК Выявление последовательности нуклеотидов в цепи. [Англо русский глоссарий основных терминов по вакцинологии и иммунизации. Всемирная организация здравоохранения, 2009 г.] Тематики вакцинология, иммунизация Синонимы… … Справочник технического переводчика
уникальные последовательности [ДНК] — уникальные последовательности [ДНК]. См. неповторяющиеся последовательности [ДНК]. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
неповторяющиеся последовательности [ДНК] — non repetitious DNA sequences уникальные (неповторяющиеся) последовательности [ДНК]. Участки молекулы ДНК, присутствующие в данном геноме в одной копии (редко в нескольких, но обычно не более 10); большинство структурных генов (за исключением тех … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
определение последовательности ДНК — — [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN DNA sequencing … Справочник технического переводчика
уникальные (неповторяющиеся) последовательности [ДНК] — Участки молекулы ДНК, присутствующие в данном геноме в одной копии (редко в нескольких, но обычно не более 10); большинство структурных генов (за исключением тех, которые составляют мультигенные семейства) представлено У.п.; в кинетике… … Справочник технического переводчика
ДНК-зонд — (англ. DNA probe) фрагмент ДНК, меченный тем или иным образом и использующийся для гибридизации со специфическим участком молекулы ДНК. Позволяет идентифицировать комплементарные ему нуклеотидные последовательности. Описание ДНК при… … Википедия
ДНК — Двойная спираль ДНК Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) один из двух типов нуклеиновых кислот, обеспечивающих хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию генетической программы развития и функционирования живых организмов. Основная… … Википедия
ДНК-маркер — Рис.1 Электрофорез ПЦР продуктов в агарозном геле и окрашенных бромистым этидием, полученных методом IRAP амплификации. Левая дорожка ДНК известной длины (от 900 до 3000 пар нуклеотидов) … Википедия
ДНК-дактилоскопия — Эту страницу предлагается переименовать в Геномная экспертиза. Пояснение причин и обсуждение на странице Википедия:К переименованию/27 сентября 2012. Возможно, её текущее название не соответствует нормам современного русского языка… … Википедия
ДНК-микролинейка — DNA Microarrays ДНК микролинейка Организованное размещение молекул ДНК на платформе из стекла, пластика или кремния. На небольшую поверхность с большой плотностью в определённом порядке наносятся фрагменты одноцепочечной синтетической ДНК с… … Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.
ДНК-метилтрансфераза — ДНК метилтрансферазы (ДНК метилазы, англ. DNA methyltransferase, DNA MTase, DNMT) группа ферментов, катализирующих метилирование нуклеотидных остатков в составе ДНК. Активность метилтрансфераз, заключающаяся в (переносе метильных (CH3… … Википедия
